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非小細(xì)胞肺癌基因檢測應(yīng)該怎么做?檢測哪些項(xiàng)目?選貴的?選快的?

 藍(lán)調(diào)閑人 2019-03-06

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展大大延長了晚期非小細(xì)胞肺癌患者的生存期,而基因檢測則是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ),因此新確診的晚期非小細(xì)胞肺癌患者進(jìn)行基因檢測已經(jīng)是標(biāo)準(zhǔn)操作

不過很多朋友還有困惑,到底應(yīng)該選擇檢測哪些基因?是選擇在醫(yī)院檢測幾個基因,還是找第三方檢測機(jī)構(gòu)做全基因檢測呢?其實(shí)基因檢測怎么做主要考慮以下的因素:費(fèi)用、時間和組織樣本量。

必檢基因和選檢基因

美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)發(fā)布的2019版非小細(xì)胞肺癌指南里面推薦檢測4個基因,即EGFR、ALK、ROS1、BRAF。

這四個驅(qū)動基因都有成熟的靶向治療藥物,其中EGFR突變在東亞非吸煙女性肺腺癌患者中的檢出率非常高。

除了這個基因外,NCCN指南還推薦檢測PD-L1表達(dá),這與免疫治療相關(guān)。

雖然PD-L1表達(dá)不屬于基因檢測,但檢測PD-L1需要用組織樣本,因此穿刺活檢時需要考慮PD-L1檢測的需求,要盡量取得足夠的組織樣本。

除了推薦必檢的基因外,NCCN專家組還強(qiáng)烈建議進(jìn)行廣泛的分子檢測。

其目的在于識別罕見的驅(qū)動突變,因?yàn)獒槍@些驅(qū)動突變的有效藥物可能已經(jīng)存在,或者可酌情建議患者入組現(xiàn)有的相應(yīng)臨床試驗(yàn)。

那么“更廣泛的分子檢測“到底是檢測哪些基因呢?NCCN指南沒有明確推薦。

從目前的臨床研究看有潛在有效藥物驅(qū)動基因包括NTRK、RET、MET、HER2,這些可以作為選檢基因。

有些基因不指導(dǎo)用藥,但有助醫(yī)生判斷病情,比如RB1,TP53雙突變非小細(xì)胞肺癌患者容易出現(xiàn)小細(xì)胞肺癌轉(zhuǎn)化,有條件亦可檢測。

此外腫瘤突變負(fù)荷(TMB)有助判斷患者預(yù)后和免疫治療療效,腫瘤突變負(fù)荷是統(tǒng)計腫瘤細(xì)胞基因突變總量,因此要獲得腫瘤突變負(fù)荷數(shù)據(jù)就要進(jìn)行大數(shù)量(數(shù)百個乃至全基因)的基因檢測。

由此看來檢測的基因越多,越全面,越能精準(zhǔn)地制定治療方案,但在真實(shí)世界里面,基因檢測受到費(fèi)用,時間和組織樣本量的制約,需要綜合考慮。

檢測大量基因,二代測序費(fèi)用最劃算

真實(shí)世界里面檢測費(fèi)用是一個重要的制約因素,因?yàn)樵诤芏鄧野绹?,不少基因檢測項(xiàng)目醫(yī)療保險并不報銷,需要患者自付。

Lester J等人的研究顯示采用PCR法、FISH法順序檢測EGFR-ROS1-ALK預(yù)期的費(fèi)用是2227美元,這3個基因是NCCN指南2017年版推薦的必檢基因。

而用二代測序(NGS)同時檢測這3個必檢基因預(yù)期費(fèi)用是2500美元,采用PCR法 、FISH法同時檢測3個必檢基因的費(fèi)用與二代測序相似。

如果加上5個選檢基因,總共8個基因,則二代測序費(fèi)用最劃算,檢測的基因越多二代測序越劃算。

時間緊迫,二代測序不一定趕得及

真實(shí)世界里面除了考慮檢測費(fèi)用,還需要考慮檢測時間,對于急需開始治療的患者,時間就是生命。

PCR法、FISH法檢測基因一般三甲醫(yī)院病理科均可開展,如果只檢測NCCN指南推薦的3-4個必檢基因,一般1-2周即可有檢測結(jié)果,而二代測序一般需要將檢測樣本送至第三方檢測機(jī)構(gòu)進(jìn)行檢測,一般需要3周時間才有檢測結(jié)果。

此外第三方檢測機(jī)構(gòu)良莠不齊,選擇檢測機(jī)構(gòu)也需要花費(fèi)時間。

二代測序需要的組織樣本量相對少

基因檢測需要腫瘤組織樣本,晚期患者無法手術(shù),基本只能通過穿刺活檢獲得少量組織樣本,這些有限的腫瘤組織樣本既要做病理檢測,又要做基因檢測,還要做PD-L1檢測,因此組織樣本可能不夠用。

二代測序能以相對少的組織樣本量檢測更多的基因,在目前需要檢測的項(xiàng)目越來越多的情況下優(yōu)勢明顯。

至于通過外周血檢測ctDNA,由于假陰性率較高,目前一般作為無法取得組織樣本時的輔助檢測。

此外如果患者急需進(jìn)行基因檢測開展治療,血液檢測取樣較簡易省時,也可以作為先行的檢查手段,外周血ctDNA檢測驅(qū)動基因如果出現(xiàn)陽性結(jié)果也可指導(dǎo)靶向治療。

綜合考慮,適合的才是最好的

目前的趨勢是需要進(jìn)行越來越多的基因檢測,二代測序在有限的組織樣本量下檢測大量基因的成本是最低的

但患者的實(shí)際情況各有不同,如果患者急需治療或經(jīng)濟(jì)條件非常有限,以PCR、FISH甚至免疫組化檢測3-4個NCCN指南推薦的驅(qū)動基因也是適合的。

參考資料:

1、NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology:Non-Small Cell Lung Cancer(Version 2.2019)

https://www./professionals/physician_gls/recently_updated.aspx

2、Lester J. Layfield et al. Molecular Testing Strategies for Pulmonary Adenocarcinoma

An Optimal Approach With Cost Analysis.

Doi: 10.5858/arpa.2018-0218-OA

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