《針灸甲乙經(jīng)》的誕生順應了歷史發(fā)展之潮流。隨著《黃帝內(nèi)經(jīng)》的問世，中醫(yī)理論體系基本完備，針灸學術(shù)思想日臻成熟?！端貑枴贰鹅`樞》等已有針灸學理論、技術(shù)思想的闡述，當時也有若干針灸學專著傳世，然或散落殘佚，或散見而不成系統(tǒng)。作為史學家，皇甫謐在年近50歲時，因患“風痹”病及耳聾，開始鉆研針灸，廣搜《黃帝內(nèi)經(jīng)》前各種針灸醫(yī)書，并“刪其浮辭，除其重復，論其精要”。他在自序中說：“撰集三部，使事類相從?！薄夺樉募滓医?jīng)》就是以《素問》《靈樞》《明堂孔穴針灸治要》有關(guān)內(nèi)容為基礎，結(jié)合歷代醫(yī)學名家論述和自己經(jīng)驗，對針灸經(jīng)絡、腧穴、主治等從理論到臨床進行了比較全面系統(tǒng)的整理匯集。這種歸類匯集的整理方法也為后人編撰類書提供了良好的開端和典范。其中所分列的經(jīng)絡、腧穴、刺法灸法、針灸治療等內(nèi)容早已成為當今針灸學科內(nèi)涵劃分的基本框架。在《針灸甲乙經(jīng)》成書之后，不論是宋王惟一創(chuàng)制針灸銅人、著書和刻石以廣針灸之正確流傳，或是明、清諸針灸學者編撰針灸書籍，幾乎無不以之為主要依據(jù)?！夺樉募滓医?jīng)》成書后，為歷代醫(yī)學家、針灸學家所重視，傳抄者頗多，自北宋校正醫(yī)書局校正后始成今之傳本。

《針灸甲乙經(jīng)》在針灸理論上，有很多學術(shù)建樹。不僅保存了大量針灸古文獻資料，弘揚了《內(nèi)經(jīng)》針灸學術(shù)思想；而且集西晉以前腧穴學之大成，確立了針灸操作規(guī)范，匯集豐富了臨床治療經(jīng)驗；其學術(shù)思想也傳播國內(nèi)外，促進了世界醫(yī)學文化的交流。

系統(tǒng)整理了十四經(jīng)腧穴。提出分部劃線布穴的排列穴位方法，記載了經(jīng)穴別名70多個，補充完善《內(nèi)經(jīng)》，記載交會穴80多個，提出“脈氣所發(fā)”穴100多個，增補完善了五輸穴的體系和內(nèi)容。而且對各穴位包括穴位的別名、部位、取法、何經(jīng)所會、何經(jīng)脈氣所發(fā)、禁刺、禁灸、誤針誤灸所帶來的不良后果、針刺深度、留針時間、艾灸壯數(shù)，都作了詳細描述。同時增補了之前典籍未能收入的新穴，使全書定位孔穴達到349個，比《內(nèi)經(jīng)》增加189個穴位。《針灸甲乙經(jīng)》還系統(tǒng)論述了經(jīng)絡學說，在晉以前醫(yī)學文獻的基礎上，對其進行了比較全面的整理研究，對人體的十二經(jīng)脈、奇經(jīng)八脈、十五絡脈以及十二經(jīng)別、十二經(jīng)筋等內(nèi)容之生理功能、循行路線、循行規(guī)律以及發(fā)病特點等作了理論概括和系統(tǒng)論述，成為后世研究的依據(jù)。

確立了針灸操作規(guī)范。對持針之姿勢方法，針刺之淺深、方向、輕重事故之預防以及留針時間、艾灸壯數(shù)、腧穴禁針、腧穴不能深刺等等，均作了明確規(guī)范的表述。不僅對身體各部位的針刺深度提出了要求，保證了針刺安全；而且對200多穴的留針時間以及艾灸壯數(shù)作了明晰精準的說明。同時還指出了誤刺誤灸的不良后果；也最早記載了應用化膿灸的理論和技術(shù)要求。此外，還特別指出誤刺誤灸的不良后果。記載有誤針引起不良后果的穴位13個，誤灸引起不良后果的穴位有29個。既有對前代經(jīng)驗的總結(jié)，又有一定的創(chuàng)造，從文獻學價值和指導后世針灸發(fā)展都有重要意義。

匯集豐富了臨床治療經(jīng)驗?；矢χk歸納了不同疾病的選穴經(jīng)驗，記載了500多個處方，論述了200多種病癥的治療，尤其重視婦科和兒科。特別是在前人經(jīng)驗基礎上，圍繞針灸適應癥這一關(guān)鍵臨床問題作了系統(tǒng)梳理，提出適合針灸治療的疾病和癥狀等共計800余種，使學習者易于掌握，同時對針灸方法和臨床禁忌也作了闡述。提示為病人施治，必須掌握時機，根據(jù)病人的不同體質(zhì)與病情，采用不同的針刺艾灸手法和技術(shù)。特別值得一提的是，《針灸甲乙經(jīng)》還專篇闡述了每日時辰不同與選穴、針刺補瀉方法的關(guān)系，這一時間醫(yī)學問題至今在臨床上還在應用，并為國際學者關(guān)注和研究。

1700多年以來，《針灸甲乙經(jīng)》早已成為古今中外針灸醫(yī)生的學習寶典，提供了臨床治療的具體指導和理論根據(jù)。早在隋唐時期，《針灸甲乙經(jīng)》就已作為醫(yī)學教育必學課本，藥王孫思邈在《大醫(yī)習業(yè)》中說，“凡欲為大醫(yī)，必須諳《素問》《甲乙》……等諸部經(jīng)方”，將之定為醫(yī)學生必讀書目。唐宋官學教育中，也明確規(guī)定其為醫(yī)學校學習必修課，并設針博士、針助教、針師等進行授課和據(jù)以指導臨床實習?！夺樉募滓医?jīng)》在國外也產(chǎn)生了廣泛影響，受到世界各國尤其是日本、朝鮮的重視。公元七八世紀，日本、朝鮮均在其醫(yī)學教育中明確規(guī)定以《針灸甲乙經(jīng)》為教材，還規(guī)定了學習日數(shù)?？梢哉f，《針灸甲乙經(jīng)》的學術(shù)價值具有極為深遠的世界影響。