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肺炎克雷伯菌:一種常見(jiàn)的機(jī)會(huì)性病原體

 新用戶(hù)7626cBpv 2021-12-02

肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)由Carl Friedlander在1882年首次報(bào)道,其屬于革蘭氏陰性桿菌中的腸桿菌科,是克雷伯氏菌屬的重要成員。該菌鏡下呈現(xiàn)粗短狀桿菌,存在莢膜,同時(shí)具有O抗原和K抗原(即菌體抗原和莢膜抗原)。

雷伯菌屬在植物、動(dòng)物和人類(lèi)等自然界環(huán)境中普遍存在,但是該菌屬還可以引發(fā)人類(lèi)多種感染,如呼吸系統(tǒng)感染,泌尿系統(tǒng)感染(UTI)、神經(jīng)系統(tǒng)感染、腹腔內(nèi)感染和血流感染等(Podschun和Ullmann,1998),尤以肺炎克雷伯菌報(bào)道較多且相關(guān)研究較為深入。因此,本文主要針對(duì)肺炎克雷伯菌的一些常見(jiàn)臨床和微生物學(xué)特征進(jìn)行綜述。

1.醫(yī)院獲得性感染的機(jī)會(huì)病原體


肺炎克雷伯菌是革蘭氏陰性桿菌。該菌在瓊脂培養(yǎng)基上可形成粘液表型,這種表型與其附著在細(xì)菌外膜上的多糖莢膜相關(guān),并可代謝乳糖。腸桿菌科家族包含了很多嚴(yán)重威脅公共衛(wèi)生健康的菌屬,例如大腸桿菌,耶爾森菌,沙門(mén)氏菌和志賀氏菌,而肺炎克雷伯菌是該家族中的重要組成成員。

肺炎克雷伯菌是美國(guó)醫(yī)院獲得性感染(Hospital-acquired Infection, HAIs)的主要致病病原體,通常引發(fā)住院或免疫功能低下宿主的感染。在美國(guó),克雷伯菌已被確認(rèn)為HAIs的第三大誘因(9.9%),僅次于艱難梭菌和金黃色葡萄球菌。肺炎克雷伯菌引起嚴(yán)重的感染,包括肺炎,尿路感染和血液感染。

更為重要的是,肺炎克雷伯菌能夠獲得越來(lái)越多賦予抗菌藥物相關(guān)的耐藥性的基因元件,從而使其成為世界衛(wèi)生組織的重點(diǎn)關(guān)注對(duì)象-ESKAPE(糞腸球菌,金黃色葡萄球菌,肺炎克雷伯菌,鮑曼不動(dòng)桿菌,銅綠假單胞菌和腸桿菌屬),迫切需要新型抗菌藥物的研發(fā)來(lái)緩解其所致的“緊急威脅”。

實(shí)際上,在美國(guó),肺炎克雷伯菌已成為醫(yī)院獲得性肺炎(入院前不存在且不在病原體潛伏期內(nèi),而在入院后48小時(shí)內(nèi)發(fā)現(xiàn)的肺炎)的第三大原因。呼吸機(jī)相關(guān)肺炎占醫(yī)院獲得性肺炎的83%。在重癥監(jiān)護(hù)病房(Intensive Care Unit, ICU)內(nèi),克雷伯菌屬同樣是呼吸機(jī)相關(guān)性肺炎(Ventilator-associated Pneumonia, VAP)的主要致病病原體。更為重要的是,有研究報(bào)道肺炎克雷伯菌所致感染的死亡率高達(dá)50%。

在革蘭氏陰性菌所致血流感染中,肺炎克雷伯菌繼大腸桿菌之后的第二大病原體。肺炎克雷伯菌所致醫(yī)院院內(nèi)獲得性血流感染的患者,多患有惡性腫瘤的基礎(chǔ)疾??;但是該菌所致社區(qū)獲得性血流感染中,患者多患有肝病和糖尿病等基礎(chǔ)疾病。血流感染可以是原發(fā)感染灶,亦可以是其他感染源(如泌尿系統(tǒng),胃腸道,靜脈或?qū)Ч芤约昂粑到y(tǒng))遷徙導(dǎo)致的繼發(fā)感染。

需要關(guān)注的是,肺炎克雷伯菌引發(fā)的血流感染的死亡率約為20-30%,群體死亡率約為每10萬(wàn)人中1.3例。

泌尿系統(tǒng)是肺炎克雷伯菌最常見(jiàn)的感染部位,患者多有糖尿病等相關(guān)病史。此外,我們不應(yīng)忽視的是,導(dǎo)管相關(guān)尿路感染(CAUTI)同樣可由肺炎克雷伯菌引發(fā)。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),形成生物被膜并粘附在導(dǎo)管上的能力促進(jìn)了導(dǎo)管相關(guān)感染的發(fā)生。此外,肺炎克雷伯菌亦可引發(fā)傷口或手術(shù)相關(guān)部位的感染,約占該菌所致所有感染類(lèi)型中的13%。

2.肺炎克雷伯菌的耐藥性


美國(guó)疾病控制和預(yù)防中心估算,每年有超過(guò)200萬(wàn)人感染抗生素耐藥病原體,并約有23,000人死于感染。目前已經(jīng)明確的是,多種因素可促使抗生素耐藥性的傳播,包括在醫(yī)療保健和農(nóng)業(yè)中不合理使用抗生素和新型抗感染治療方案的缺乏。肺炎克雷伯菌是過(guò)去幾十年來(lái)抗生素耐藥性急劇增加的幾種細(xì)菌之一,其中對(duì)β-內(nèi)酰胺的耐藥性對(duì)臨床病人的預(yù)后影響較大。

盡管目前尚不能完全明確病原體從定植到感染的相關(guān)關(guān)系,但是住院患者中耐藥性的肺炎克雷伯菌的定植,與其隨后出現(xiàn)的抗生素耐藥性肺炎克雷伯菌的感染確有一定的聯(lián)系。

2.1
產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶的肺炎克雷伯菌

在青霉素被廣泛應(yīng)用前,細(xì)菌已經(jīng)對(duì)β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素產(chǎn)生了耐藥性。亞歷山大·弗萊明(Alexander Fleming)首次發(fā)現(xiàn)大腸桿菌和其他細(xì)菌不受青霉素抑制的情況,這種耐藥后來(lái)歸因于這些細(xì)菌產(chǎn)生的一些酶類(lèi)。

簡(jiǎn)而言之,通過(guò)β-內(nèi)酰胺酶可以水解抗生素β-內(nèi)酰胺環(huán),繼而實(shí)現(xiàn)病原體對(duì)β-內(nèi)酰胺抗生素的耐藥性。

需要關(guān)注的是,肺炎克雷伯菌中天然存在針對(duì)某些β-內(nèi)酰胺藥物的抗性,因?yàn)樵撁冈谖锓N的核心基因組中編碼相應(yīng)蛋白,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)某些β-內(nèi)酰胺藥物的耐藥表型出現(xiàn)。

舉例來(lái)說(shuō),SHV耐藥基因定位在肺炎克雷伯菌菌株的染色體上,從而使該菌對(duì)氨芐青霉素天然耐藥。隨著研究的深入,肺炎克雷伯菌還可以從別的菌株/菌屬中,通過(guò)水平轉(zhuǎn)移攝取介導(dǎo)β內(nèi)酰胺酶抗生素的基因元件。有學(xué)者認(rèn)為,在環(huán)境選擇性壓力作用下,β-內(nèi)酰胺酶可能是是從青霉素結(jié)合蛋白進(jìn)化而來(lái)的。

2.2
超廣譜β-內(nèi)酰胺酶

超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBL)是定位于質(zhì)粒的耐藥基因,形成針對(duì)多種抗生素耐藥表型的分子機(jī)制,屬于輔助基因組的一部分,也即非必須基因組。產(chǎn)ESBL的肺炎克雷伯菌于1983年在歐洲被首次報(bào)道,6年后美國(guó)本土亦報(bào)道了該耐藥菌的出現(xiàn)。ESBL能夠水解包括第三代頭孢菌素和氨曲南在內(nèi)的多種抗生素,但其可被克拉維酸抑制。

需要注意的是,編碼β-內(nèi)酰胺酶的質(zhì)粒通常還攜帶有對(duì)其他抗生素以及重金屬的相關(guān)抗性基因。因此,ESBL與其他輔助相關(guān)基因緊密相連,可能有助于改善所在菌株的生物適應(yīng)性。

2.3
肺炎克雷伯菌對(duì)多粘菌素和碳青霉烯類(lèi)等高級(jí)別抗生素的抗性

隨著新型抗生素-碳青霉烯類(lèi)抗生素的問(wèn)世,使得菌株在抗生素選擇壓力下呈現(xiàn)出碳青霉烯和或多粘菌素的耐藥性,使得該菌成為最常見(jiàn)的耐碳青霉烯類(lèi)腸桿菌科(carbapenem-resistant enterobacteriaceae, CRE)中重要的一員。

有報(bào)道稱(chēng),克雷伯菌屬所致感染已占CRE所致感染的80%。因此,在2013年,美國(guó)疾病預(yù)防控制中心宣布CRE已經(jīng)對(duì)美國(guó)的公共衛(wèi)生構(gòu)成緊急威脅。

肺炎克雷伯菌對(duì)碳青霉烯類(lèi)藥物的耐藥性主要取決于以下幾點(diǎn):

  • 外排泵的上調(diào);

  • 核心基因組中外膜孔蛋白的改變;

  • ESBL酶的高表達(dá);

  • AmpC型β-內(nèi)酰胺酶的嵌入。碳青霉烯耐藥性最令人擔(dān)憂(yōu)的機(jī)制,是通過(guò)質(zhì)粒介導(dǎo)的碳青霉烯酶(KPC)在菌株/菌屬中間的傳播,其屬于A類(lèi)絲氨酸碳青霉烯酶,是肺炎克雷伯菌中最常見(jiàn)的碳青霉烯酶,可以在革蘭氏陰性菌內(nèi)進(jìn)行廣泛傳播,繼而使得受體菌株呈現(xiàn)出相應(yīng)的抵抗碳青霉烯類(lèi)抗生素的表型。

Colistin屬于多粘菌素類(lèi)抗生素,在19實(shí)際60-70年代間主要用于治療革蘭氏陰性菌感染,但由于其存在著腎臟和神經(jīng)的毒副作用,使得該藥在一段時(shí)間內(nèi)消失在了我們的視野中。但是,近來(lái)出現(xiàn)的多耐藥肺炎克雷伯菌,迫使我們回到了“老藥新用”時(shí)代。

我們不得不同樣面對(duì),抗生素選擇壓力下耐藥菌株的出現(xiàn)。我國(guó)學(xué)者首次發(fā)現(xiàn)了定位于質(zhì)粒的mcr-1耐藥基因不僅可以介導(dǎo)多粘菌素的耐藥,亦可以在不同菌株/菌屬之間進(jìn)行快速傳播。

回顧我國(guó)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)Chinet顯示,從2005年至今,革蘭氏陰性桿菌在我國(guó)檢出率持續(xù)升高,已超過(guò)70%。需要注意的是,肺炎克雷伯菌自2005年之后的檢出率逐年升高,已成為僅次于大腸桿菌的第二大革蘭氏陰性病原體。

更為重要的是,對(duì)碳青霉烯類(lèi)抗生素耐藥的肺炎克雷伯菌的檢出率亦呈現(xiàn)逐年上升趨勢(shì),目前已超過(guò)20%,在我國(guó)部分省份檢出率甚至超過(guò)了50%,給我國(guó)帶來(lái)了巨大的社會(huì)和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。

有意思的是,肺炎克雷伯菌逐漸進(jìn)一步凈化為兩種病原體:高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,hvKp)和經(jīng)典肺炎克雷伯菌(classical Klebsiella pneumoniae,cKp),并且引發(fā)了不同的臨床感染類(lèi)型和特征,需要在臨床實(shí)踐中予以高度重視,從而選用合適的抗生素管理策略。

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