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Omicron困擾科學(xué)家的四個(gè)問題 |《自然》長(zhǎng)文

 嘟嘟7284 2022-03-18

原文作者:Amber Dance

快速傳播的Omicron為病毒的傳播、嚴(yán)重性和演化提出了新的問題。

當(dāng)前,新冠病毒(SARS-CoV-2)變異株Omicron在全球許多國(guó)家的感染率急劇下降。但Omicron的擴(kuò)散速度為何如此之快以及接下來會(huì)怎樣,依舊是科學(xué)家需要努力攻克的問題。尤其是眼下,Omicron的BA.2亞型正在一些地區(qū)快速傳播。

和之前的新冠病毒需關(guān)注變異株(VOC)不同,Omicron經(jīng)常能感染那些對(duì)之前毒株有抗體的人,無(wú)論這些抗體是通過感染還是通過疫苗獲得的。在科學(xué)家意識(shí)到Omicron出現(xiàn)之后的三個(gè)月里,他們已經(jīng)掌握了很多信息,但迄今為止的大部分研究都是圍繞Omicron的親株或是BA.1,許多緊迫的問題仍沒有答案。

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Omicron感染鼻子、喉嚨和肺部細(xì)胞的方式與之前的變異株不同。來源:Lucas Landau/Reuters/Alamy

Omicron在人群中的傳染力似乎很強(qiáng)——亞型BA.2甚至超過了BA.1,但嚴(yán)重性好像又不如其他變異株。Omicron是怎么做到的?搞清楚這個(gè)問題以及Omicron與宿主細(xì)胞和免疫系統(tǒng)的相互作用,或能幫助開發(fā)出更有效的藥物或疫苗。對(duì)Omicron人為施壓的實(shí)驗(yàn)室研究可以看到哪些突變會(huì)出現(xiàn),借此預(yù)測(cè)新冠病毒還會(huì)演化出哪些變異株。

“這個(gè)病毒它變了,”南非艾滋病計(jì)劃研究中心的流行病學(xué)家Salim Abdool Karim說,“它進(jìn)入細(xì)胞的方式、感染肺部的方式,以及感染鼻子的方式都發(fā)生了變化。

《自然》在此梳理了關(guān)于Omicron的幾個(gè)重要科學(xué)問題。

1. Omicron的傳播力為何這么強(qiáng)?

Omicron之所以能勝出,恐怕要?dú)w結(jié)于它有別于先前變異株的幾十個(gè)突變,這些突變能讓它逃逸宿主抗體,尤其是那些能與病毒表面刺突蛋白結(jié)合并阻斷其侵入細(xì)胞的中和抗體。也就是說,雖然人群已經(jīng)對(duì)之前的變異株建立了廣泛免疫,但與Delta流行時(shí)相比,Omicron能感染的宿主其實(shí)變多了。

不過,也有可能是Omicron的某些固有生物學(xué)特性讓它的傳染力特別強(qiáng)——與人群免疫力反而無(wú)關(guān)。或許是感染者傳播它的方式發(fā)生了變化,或許是其他人被感染的方式發(fā)生了變化,也可能是兼而有之。

傳播方式上,有觀點(diǎn)認(rèn)為Omicron能增加鼻部的病毒顆粒濃度,讓感染者每次呼氣都能呼出更多病毒。但這方面的數(shù)據(jù)還不太一致。

香港大學(xué)病毒學(xué)家陳志偉對(duì)人類肺部和支氣管組織開展的一項(xiàng)研究[1]支持了這種觀點(diǎn)。該研究顯示,Omicron在上呼吸系統(tǒng)的復(fù)制速度比之前所有的變異株都快。

帝國(guó)理工學(xué)院病毒學(xué)家Wendy Barclay領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在培養(yǎng)的鼻細(xì)胞中,Omicron的復(fù)制速度比Delta更快[2]。

但也有研究指出,沒有預(yù)存免疫的倉(cāng)鼠在肺部的病毒顆粒比感染先前變異株時(shí)少了——這些病毒顆粒都沒有傳染性[3]。其他人體研究[4,5]發(fā)現(xiàn),Omicron在上呼吸道產(chǎn)生具有傳染性的病毒顆粒水平與Delta持平或更少。(參見:我該拿你怎么辦:Omicron讓防疫政策更難了

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一個(gè)胞內(nèi)體內(nèi)部的新冠病毒顆粒(綠色)。來源:NIAID (CC BY 2.0)

如果站在這些傳染性顆粒潛在接收者的角度,Barclay認(rèn)為Omicron很強(qiáng)的傳播力度可能與它進(jìn)入細(xì)胞的方式有關(guān)。新冠病毒之前的變異株都要靠細(xì)胞受體ACE2來與宿主細(xì)胞結(jié)合,還要依賴細(xì)胞酶TMPRSS2來切割其刺突蛋白,實(shí)現(xiàn)病毒侵入。但Omicron基本上拋棄了TMPRSS2的路線,反而采取被細(xì)胞整個(gè)吞噬的方式,進(jìn)入名為內(nèi)體的細(xì)胞內(nèi)囊泡中[2,6]。

Barclay說,鼻子的許多細(xì)胞都能產(chǎn)生ACE2,但無(wú)法產(chǎn)生TMPRSS2。這會(huì)讓Omicron一被吸入就開始進(jìn)攻——無(wú)需抵達(dá)表達(dá)更多TMPRSS2的肺部等器官就能搗亂(參見:Omicron不易損傷肺部,或比Delta更溫和。這或許從一定程度上解釋了Omicron的人際傳播為何如此輕松,以及它的感染速度為何如此之快。

2. Omicron的毒力降低了嗎?如果降低了,為什么?

就住院率和死亡率來看,Omicron好像比之前的變異株弱了一些。但由于很多人已經(jīng)有了一定程度的免疫力——無(wú)論是通過接種疫苗還是通過既往感染,因此我們很難判斷這種嚴(yán)重性的降低有多少是來自人體免疫系統(tǒng)的預(yù)存免疫,又有多少是源于Omicron本身的固有特性。

“要做一個(gè)'干干凈靜’的遺傳學(xué)與免疫學(xué)研究要難得多。”紐約洛克菲勒大學(xué)兒科免疫學(xué)家Jean-Laurent Casanova說。

美國(guó)凱斯西儲(chǔ)大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究團(tuán)隊(duì)嘗試控制這些因素不變,他們的方法是研究5歲以下初次感染COVID-19的兒童病例,這些兒童還沒到可以打疫苗的年齡[7]。在急診量、住院率、重癥監(jiān)護(hù)率、機(jī)械通氣方面,Omicron病例均比Delta病例要輕一些。

在另一項(xiàng)研究[8]中,南非的研究人員分析了Omicron暴發(fā)和前幾次暴發(fā)中,成年感染者的住院和死亡風(fēng)險(xiǎn)。通過將既往感染、疫苗接種等因素納入分析數(shù)據(jù),他們推斷Omicron的重癥或死亡風(fēng)險(xiǎn)下降約有25%是源于其本身的特性。

是什么磨平了Omicron的獠牙?陳志偉的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),雖然Omicron在上呼吸系統(tǒng)游刃有余,但它在肺組織的復(fù)制能力弱了不少[1]。針對(duì)嚙齒動(dòng)物的研究也發(fā)現(xiàn),肺部出現(xiàn)的炎癥和損傷都減少了[3]

Omicron在人類肺部定植或損傷肺部的能力相對(duì)較弱,似乎令重癥肺炎和呼吸窘迫的病例減少了,但傷風(fēng)鼻塞這種讓人難受的癥狀卻增加了。

Barclay認(rèn)為,導(dǎo)致Omicron嚴(yán)重性下降的另一個(gè)特性,可能是它無(wú)法讓單獨(dú)的肺細(xì)胞融合成合胞體這種更大的細(xì)胞團(tuán)。先前的冠狀病毒變異株都有這種能力,而且因?yàn)檫@些細(xì)胞團(tuán)可以在死于重癥的感染者肺部找到,一些科學(xué)家認(rèn)為這個(gè)合胞體會(huì)導(dǎo)致癥狀或能幫助病毒傳播。但這種融合需要TMPRSS2的幫助,而Omicron感染似乎不會(huì)產(chǎn)生相同水平的合胞體[2]。

3. 什么是對(duì)Omicron的完全免疫應(yīng)答?

身體應(yīng)對(duì)病原體的一個(gè)關(guān)鍵防御機(jī)制是一種名為干擾素的分子,細(xì)胞發(fā)現(xiàn)入侵者時(shí)便會(huì)產(chǎn)生干擾素。干擾素會(huì)指示細(xì)胞加強(qiáng)自身防御,比如把病毒控制在胞內(nèi)體中。干擾素還會(huì)向未被感染的相鄰細(xì)胞發(fā)出預(yù)警信號(hào),讓它們也采取同樣的行動(dòng)。

之前的變異株能避開或擾亂干擾素的作用。一些研究顯示,Omicron的這種能力有一定程度的下降[9],但也有研究發(fā)現(xiàn),Omicron其實(shí)能更好地對(duì)抗干擾素的作用[10]。

研究人員還想知道該病毒的哪些部分引起了T細(xì)胞的注意。相比之前的變異株,能被T細(xì)胞識(shí)別的病毒蛋白在Omicron這里似乎并未發(fā)生太大變化[11]。

這是個(gè)好消息,因?yàn)槊鎸?duì)再次出現(xiàn)的入侵者,雖然T細(xì)胞的響應(yīng)速度比抗體要慢,但只要一被激活,T細(xì)胞的作用還是很強(qiáng)的。這能防止突破性感染發(fā)展為重癥。

搞清楚新冠病毒的哪些部分很少突變,并能有效激活T細(xì)胞,或能幫助疫苗設(shè)計(jì)人員開發(fā)出新的疫苗配方,誘導(dǎo)人體對(duì)當(dāng)前和今后的變異株產(chǎn)生這種長(zhǎng)效免疫。

4. 接下來會(huì)怎樣?

Barclay認(rèn)為,基于目前為止關(guān)于Omicron的全部數(shù)據(jù),Omicron在感染初期就具備很強(qiáng)的傳染力,可能是因?yàn)樗簧蟻砭秃軈柡?。但Omicron的病毒載量以及它感染其他細(xì)胞和其他人的能力,在它從上呼吸道跑到其他器官時(shí)或是遇到干擾素之后,也有可能迅速下降。

“Omicron進(jìn)入鼻細(xì)胞的本事很大,”她說,“一旦它進(jìn)入了鼻細(xì)胞,我認(rèn)為它就不再是一個(gè)適應(yīng)力很強(qiáng)的病毒了。

Omicron的嚴(yán)重性下降猶如一道烏云的金邊,但大部分專家都不認(rèn)為Omicron是最后一個(gè)需關(guān)注變異株。福瑞德·哈金森癌癥研究中心的演化病毒學(xué)家Jesse Bloom認(rèn)為接下來有兩種可能。一種可能是Omicron繼續(xù)演化,出現(xiàn)比BA.1或BA.2更厲害的升級(jí)株;另一種可能是出現(xiàn)一種與Omicron無(wú)關(guān)的全新變異株。

目前為止,所有的需關(guān)注變異株都是后一種情況。“這說明新冠病毒的可塑性非常強(qiáng),”倫敦大學(xué)學(xué)院病毒學(xué)家Lucy Thorne說,“它有不同的演化選擇。”

擁有幾十個(gè)突變的Omicron能比它之前的幾個(gè)變異株嘗試更多的演化選擇。Omicron的許多突變本應(yīng)讓它的適應(yīng)力變差,但它卻脫穎而出,很有可能是因?yàn)閯e的突變抵消了這些不利影響。

Omicron還有哪些演化選擇?為了做出合理猜測(cè),一種方式是將這個(gè)病毒在實(shí)驗(yàn)室對(duì)照條件下演化一番。阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校的研究人員發(fā)現(xiàn),當(dāng)新冠病毒在細(xì)胞培養(yǎng)物中傳了幾代之后,原始株獲得了與硫酸乙酰肝素結(jié)合的能力,硫酸乙酰肝素是一種存在于所有細(xì)胞表面的分子[12]。這種經(jīng)過培養(yǎng)的病毒仍能利用ACE2,但多一個(gè)結(jié)合對(duì)象可以讓它更容易感染細(xì)胞。

該研究的作者指出,細(xì)胞培養(yǎng)皿中出現(xiàn)的突變不絕對(duì)代表病毒感染動(dòng)物或人的能力會(huì)增強(qiáng);這些突變也可以削弱病毒在其他方面的能力。因此,這類研究并不滿足功能獲得型研究的最嚴(yán)格定義。

研究人員還能在實(shí)驗(yàn)室對(duì)該病毒施壓,讓它在有抗體或抗病毒藥物的情況下演化。比如,科學(xué)家將新冠病毒的一個(gè)早期毒株與抗病毒藥物瑞德西韋共同培養(yǎng)并傳代,結(jié)果很快就出現(xiàn)了能減弱病毒對(duì)瑞德西韋敏感度的突變[13]。

這類實(shí)驗(yàn)?zāi)茏屟芯咳藛T預(yù)測(cè)該病毒的演化方向。實(shí)驗(yàn)室中觀察到的突變不一定會(huì)在自然界出現(xiàn),但監(jiān)測(cè)追蹤冠狀病毒遺傳學(xué)變化的科學(xué)家可以特別留意這些突變。

我們已知新冠病毒能感染很多種動(dòng)物,包括水貂、鹿、倉(cāng)鼠(參見:Omicron的起源之謎︱《自然》長(zhǎng)文。一些科學(xué)家認(rèn)為,Omicron去年11月首次在南非被發(fā)現(xiàn)前,可能已經(jīng)傳染過了某種動(dòng)物宿主或多種動(dòng)物宿主。其他研究人員好奇它是否會(huì)感染比目前已知的更多的物種,隨后再傳回到人,這也許會(huì)賦予它新的、危險(xiǎn)的適應(yīng)力。

曼尼托巴大學(xué)溫尼伯分校的病毒學(xué)家Jason Kindrachuk問道,“這個(gè)病毒還去過哪里?它在那些物種中做了什么?”Kindrachuk所在團(tuán)隊(duì)正設(shè)法回答這個(gè)問題。他們?cè)谝吧鷦?dòng)物樣本中尋找Omicron的蹤跡,同時(shí)也在分析Omicron的刺突蛋白與不同物種ACE2受體的相互作用。

至于嚴(yán)重性,目前還無(wú)法保證它會(huì)繼續(xù)降低。陳志偉正在以新冠病毒對(duì)溫度的喜好作為評(píng)判其致病性的線索。附著在上呼吸道的病毒在涼爽的33°C時(shí)復(fù)制能力較好,導(dǎo)致的感染癥狀也較輕。喜歡肺部37°C的病毒很有可能毒力更強(qiáng)。陳志偉說,Omicron原始株的生長(zhǎng)能力在這兩種溫度下都沒有增強(qiáng),但他現(xiàn)在正在研究它的后代。

無(wú)論發(fā)生什么,科學(xué)家都會(huì)在接下來的幾個(gè)月里繼續(xù)研究關(guān)于Omicron的種種問題。當(dāng)前的大部分研究仍剛剛開始,或是在等待同行評(píng)審和其他實(shí)驗(yàn)室的確認(rèn)。

畢竟Omicron剛出現(xiàn)的時(shí)候,研究人員連Delta都還沒有徹底搞明白,Kindrachuk說,“我們?nèi)ツ?1月才認(rèn)識(shí)Omicron,現(xiàn)在知道的還不多?!?/p>

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原文以O(shè)micron’s lasting mysteries: four questions scientists are racing to answer為標(biāo)題發(fā)表在2022年2月24日《自然》的新聞特寫版塊上

? nature

doi: 10.1038/d41586-022-00428-5

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