火山圖為描述表達差異而存在

橫軸表示差異表達倍數(shù)（log2 fold change表示，F(xiàn)old Change值，簡稱FC，根據(jù)log2 fold change值的正負判斷這些基因的表達量是上升了還是下降了），差異越大的基因分布X軸在兩端。

縱坐標表示差異的顯著性，用-log10 p-value表示，對P值進行-log10的轉化，-log10（p-value=0.05）約等于1.30，（-log10（0.01））=2，可知縱軸越往上走P值越小，而P值越小表示越顯著。所以我們進行-log10（p -value）轉化后，值越大就表示差異越顯著。

下面我們舉個栗子

結果解讀

上圖以|logFC|=0.606且p-value=0.05為截斷標準。

logFC＞0.606且p-value＜0.05定義為上調的基因，

logFC＜-0.606且p-value＜0.05定義為上調的基因。

圖中紅色 的點表示上調的基因，藍色 的點表示下調的基因，黑點 是無顯著差異的基因。

兩條紅豎線外側為差異表達倍數(shù)為2倍以上的基因。

B1橫線以上表示p-value＜0.05，

B2橫線以上表示p-value＜0.01。

區(qū)域1表示|FC|在2倍以內且p-value>0.05，區(qū)域2和區(qū)域3表示：|FC|>2倍且p-value<0.01的基因。

懂了基礎的知識后，就去看看別人是如何描述的吧

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