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古DNA測序揭秘!這場瘟疫的源頭找到了

 金蘋果6 2022-06-20 發(fā)布于北京
文 | 李木子

一項(xiàng)對古代基因組的研究顯示,在14世紀(jì)暴發(fā)于今天吉爾吉斯斯坦的一場瘟疫中,許多人死于引起鼠疫的耶爾森氏菌菌株,該菌株產(chǎn)生的病原體在幾年后又導(dǎo)致了黑死病。

相關(guān)成果6月15日發(fā)表于《自然》。

“這就像找到了所有菌株聚集的地方?!痹撗芯抗餐?fù)責(zé)人、德國馬克斯·普朗克進(jìn)化人類學(xué)研究所古遺傳學(xué)家Johannes Krause說。

1346年至1353年,黑死病肆虐歐亞大陸西部,一些地區(qū)的死亡人數(shù)高達(dá)60%。

歷史記錄表明,黑死病起源于歐亞大陸東部:克里米亞半島的卡法在1346年最早暴發(fā)瘟疫,高加索和中亞其他地區(qū)則被認(rèn)為是潛在的“震中”。

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吉爾吉斯斯坦Kara-Djigach墓地為黑死病死者雕刻的墓碑。   圖片來源:Nature

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幾年前,英國斯特林大學(xué)經(jīng)濟(jì)和環(huán)境歷史學(xué)家、該研究共同主要作者Philip Slavin在吉爾吉斯斯坦的14世紀(jì)墓地中偶然發(fā)現(xiàn)了一些記錄,他認(rèn)為這些記錄可能會為黑死病的起源提供線索。

這兩座被稱為Kara-Djigach和Burana的墓地中有大量墓碑,可以追溯至1338年和1339年,其中有10塊墓碑明確提到了一場瘟疫。

為確定這些墓碑是否與后來的黑死病有關(guān),Slavin和Krause一起從墓地中找到了一些遺骸。

由德國圖賓根大學(xué)考古學(xué)家Maria Spyrou領(lǐng)導(dǎo)的研究小組對7具遺骸的古代DNA進(jìn)行了測序,并在Kara-Djigach的3個墓葬中發(fā)現(xiàn)了鼠疫桿菌DNA。

從數(shù)據(jù)中收集到的一對完整的鼠疫桿菌基因組顯示,這些細(xì)菌是與黑死病有關(guān)的菌株的直系祖先,其中包括Krause團(tuán)隊在2011年測序的來自英國倫敦一名死者的鼠疫桿菌樣本。

Kara-Djigach的菌株也是今天絕大多數(shù)鼠疫桿菌譜系的祖先。

“這是黑死病暴發(fā)前不久,鼠疫桿菌多樣性大暴發(fā)的一個跡象?!盞rause說,“這就像瘟疫大爆炸?!?/span>

其他證據(jù)表明,黑死病起源于中亞地區(qū)。

在鼠疫桿菌的現(xiàn)代菌株中,從吉爾吉斯斯坦、哈薩克斯坦等地的旱獺和其他嚙齒動物身上采集的樣本,與Kara-Djigach菌株關(guān)系最為密切。

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嚙齒動物是鼠疫桿菌的天然宿主,而人類只有在跳蚤等媒介傳播感染時才會患上鼠疫。

Krause懷疑,人類與受感染的旱獺的密切接觸引發(fā)了當(dāng)時吉爾吉斯斯坦的疫情,而歐洲免疫系統(tǒng)不成熟的鼠群助長了黑死病。

Slavin說,中亞作為黑死病的“震中”是有道理的。

該地區(qū)位于古絲綢之路貿(mào)易線上,在吉爾吉斯斯坦的墳?zāi)怪邪l(fā)現(xiàn)了來自印度洋的珍珠、地中海的珊瑚和外國硬幣,這表明遙遠(yuǎn)的貨物經(jīng)過該地區(qū)。

“我們可以假設(shè),遠(yuǎn)距離和區(qū)域貿(mào)易在病原體向西傳播中發(fā)揮了重要作用?!?/span>

美國中世紀(jì)歷史學(xué)家和獨(dú)立學(xué)者M(jìn)onica Green說,從黑死病的祖先鼠疫細(xì)菌中獲取基因組是“一個巨大突破”。

丹麥哥本哈根大學(xué)計算生物學(xué)家Simon Rasmussen補(bǔ)充道,“從古代亞洲獲取更多的鼠疫樣本會非常有趣,因?yàn)檫@將為第一次和第二次(鼠疫)大流行的亞洲起源提供更多證據(jù)?!?/span>


編輯 | 計紅梅
排版 | 郭   剛


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