細(xì)胞外囊泡 (extracellular visicles,EV) 是由細(xì)胞釋放出的攜帶并保護(hù)細(xì)胞來源生物信息分子物質(zhì)的特殊結(jié)構(gòu),可通過轉(zhuǎn)運核酸和蛋白質(zhì)等生物信息物質(zhì)參與體內(nèi)靶細(xì)胞的信號調(diào)節(jié),并作為藥物或疫苗的載體在抗腫瘤治療、干細(xì)胞治療等領(lǐng)域發(fā)揮關(guān)鍵作用,而其中EV中的RNA分子 (exoRNA) 因其獨特的表達(dá)模式而受到了最為廣泛的關(guān)注。 一、外泌體及miRNA純化
① 外泌體純化 沉淀法miRCURY?外泌體純化試劑盒 暢銷 ※ 從不同起始材料中進(jìn)行外泌體提?。耗蛞簶颖?-10 mL,CSF樣本1 mL,細(xì)胞培養(yǎng)液 1-10 mL ;血漿/血清0.2-1.4mL ※ 2小時內(nèi)完成外泌體提取 ※ 無需高速離心及酚/氯仿提取 ※ 適用于多種應(yīng)用,如miRNA或RNA profiling 訂購信息 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 | miRCURY Exosome Serum/Plasma Kit | 沉淀法,從血清或血漿中提取外泌體及其他胞外囊泡 | 76743 |
親和柱膜法外泌體分離及外泌體內(nèi)RNA(含miRNA)的純化 exoEasy Maxi Kit 貨號:76064 從血漿、血清、細(xì)胞培養(yǎng)上清及其他生物液體中分離完整的exosome及其他細(xì)胞外囊泡 ※ 適用于囊泡功能性檢測及物理和生化分析 ※ 可在25分鐘內(nèi)純化獲得exosome及其他細(xì)胞外囊泡 ※ 離心柱純化流程,可平行處理多個樣品 ※ 可處理大體積的樣品(4 ml血漿或血清,或32ml細(xì)胞培養(yǎng)上清),靈敏檢測低豐度轉(zhuǎn)錄本 exoRNeasy Serum/Plasma Kit 暢銷 采用親和性膜離心柱,可從來自血清、血漿、尿液、細(xì)胞上清等樣本中分離exosome和其他細(xì)胞外微泡中高效分離RNA。該試劑盒能夠快速、便利的獲得結(jié)果,十分適用于敏感的下游應(yīng)用。 訂購信息 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 | exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit (50) | 過柱法,直接從樣本里面得到外泌體里面的RNA,4ml上樣量 | 77144 | exoRNeasy Serum/Plasma Starter Kit (20) | 過柱法,直接從樣本里面得到外泌體里面的RNA, 10個4ml+10個1ml上樣的柱子 | 76064 |
特殊樣本外泌體及miRNA純化試劑盒訂購指南 提取方法 | 適用樣本 | 上樣量 | 貨號 | 品名 | 規(guī)格 | 說明 |
| 膜親和法 | 血漿、血清、腦脊液 | 1-4ml | 76214 | Buffer XE (45 ml) | 45ml | 洗脫囊泡的buffer |
| 細(xì)胞培養(yǎng)上清 | 8ml | 77164-Qiagen | exoRNeasy Maxi Kit (50) | 50T | 提取外泌體以及外泌體中的總RNA | 樣本量大于8ml | 76214 | Buffer XE (45 ml) | 45ml | 洗脫囊泡的buffer |
| 尿液 | 4ml | 77164-Qiagen | exoRNeasy Maxi Kit (50) | 50T | 提取外泌體以及外泌體中的總RNA | / | 74204 | RNeasy MinElute Cleanup Kit (50) | 50T | 用于尿液樣本中short RNA的提取的柱子 |
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② miRNA純化:Copurifcation of miRNA and total RNA 產(chǎn)品特點: ※ 可以單獨富集各種組織、細(xì)胞樣品中的miRNA和其他小RNAs (>18nt),做芯片分析時單獨分離可能會有幫助 ※ 推薦同步純化包含miRNA的總RNA,這樣有助于一次cDNA合成可以獲得所有類型RNA信息,便于同時進(jìn)行miRNA,mRNA或其他非編碼RNA檢測 ※ 硅膠膜技術(shù)確保獲得最好純度miRNA,不會有Trizol方法帶來的選擇性miRNA丟失,適合各種下游檢測 miRNeasy Serum/Plasma Kit (貨號:217184) ※ 同樣使用經(jīng)典的硅膠膜法 ※ 該試劑盒適用于使用檸檬酸鹽或EDTA抗凝的血清 (不能使用肝素,會干擾下游的實驗) ※ 保證清洗緩沖液的溫度在20-30°C,否則會有鹽類的殘留 ※ 配合使用Spick-in control,對純化效率及下游檢測進(jìn)行監(jiān)測 miRNeasy Serum/Plasma Kit | RNA片段選擇 | 大于18nt | 起始樣本量 | 200ul | 最小洗脫體積 | 10ul | RNA產(chǎn)量 | 60-150ng | 內(nèi)參 | C.elegans miR-39 |
miRNeasy Serum/Plasma Advanced Kit (貨號:217204) 暢銷 ※ 無需苯酚裂解,更易于在QIAcube進(jìn)行自動化操作 ※ 采用UCP MinElute純化柱,更安全、更小洗脫體積 ※ 純化高品質(zhì)含胞外/外泌體非編碼RNA(miRNA)的總RNA,適合任何下游應(yīng)用 miRNA純化試劑盒訂購指南 樣本類型 | 試劑盒名稱 | 試劑盒貨號 | 樣品量 | 洗脫體積 | 處理 | 純化類型 | 應(yīng)用 |
| 動物組織或細(xì)胞 | miRNeasy Mini Kit | 217084 | 5mg(脂肪10mg)組織, 1 x 10 6細(xì)胞 | 10ul |
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| miRNeasy 96 Kit | abs60261 | 10-20mg的組織 | 30ul | 手動 | miRNA | PCR, qPCR, real-time RT-PCR, microarray |
| 細(xì)胞miRNA提取試劑盒 | 217604 | 最多30 mg冷凍組織(15 mg穩(wěn)定組織), 最多1 x 107的細(xì)胞 | 30 μl | 手動(監(jiān)控),自動(QIAcube連接) | miRNA, total RNA | NGS, real-time RT-PCR, microarray |
| miRNeasy Tissue/Cells Advanced Micro kit | 80224 | 組織:不超過30 mg的新鮮或冷凍組織;細(xì)胞:不超過1 x 107細(xì)胞 | / | / | DNA、RNA、miRNA | / | 血液樣本 | 血液miRNA提取試劑盒 | abs60263 | 200μL外泌體樣本 | 40 μl | 手動 | Total RNA,miRNA, | PCR, qPCR, real-time RT-PCR, microarray | FFPE組織切片 | miRNeasy FFPE Kit | 76544 | 100 μl or 500 μl animal blood | 14 μl | 手動(離心) | Total RNA | Northern、雜交、RT-PCR、定量、實時RT-PCR、下一代測序、陣列分析 | PAXgene Tissue Container 中的組織 | PAXgene Tissue miRNA Kit | 763134 | 2.5 ml | 40 μl | 手動(離心)或在QIAcube上 | miRNA | RT-PCR和實時RT-PCR、cDNA合成、northern、dot和slot blot分析、引物延伸、微陣列分析 | 血清、血漿、尿液等無細(xì)胞體液 | miRNeasy Serum/Plasma Advanced Kit | abs60264 | ≤ 200ul | 30ul | 手動(離心) | RT-PCR和實時RT-PCR、cDNA合成、northern、dot和slot blot分析、引物延伸、微陣列分析 |
| miRNeasy Serum/Plasma Kit | 217004 | 50mg(脂肪100mg)組織,1 x 107細(xì)胞 | 30 μl | 手動(離心或真空) | miRNA, total RNA | PCR, qPCR, real-time RT-PCR, microarray |
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二、miRNA定量 ① miRCURY LNA miRNA qPCR檢測系統(tǒng) Exiqon microRNA qPCR系統(tǒng)將通用逆轉(zhuǎn)錄的高靈敏度,高效率與鎖核酸修飾的定量引物的高特異性相結(jié)合,在3個小時之內(nèi)即可完成microRNA表達(dá)分析。miRCURY LNA miRNA qPCR系統(tǒng)可提供assays及panels規(guī)格,20ng total RNA無需預(yù)擴增即可在96孔及384孔板上進(jìn)行上百microRNAs的精準(zhǔn)定量。miRCURY LNA miRNA qPCR檢測系統(tǒng)具有以下特點: ● 極高的靈敏度:低至1pg total RNA即可進(jìn)行可靠的定量 ● 極高的特異性:LNA引物可精確區(qū)分只有一個堿基差異的miRNA異構(gòu)體 ● 實驗操作簡單方便:在3小時內(nèi)即可完成從樣本到數(shù)據(jù)分析的整個流程 miRCURY LNA RT kit (貨號:339340) 用于一鏈合成,與miRCURY LNA miRNA PCR Assays / Panels搭配使用效果最佳,包含RNA spike-in模板。 miRCURY LNA miRNA PCR Assay / Custom PCR Assay / miRCURY LNA miRNA PCR Panels 200次反應(yīng)的預(yù)制或定制LNA miRNA PCR primers,用于目標(biāo)miRNA表達(dá)水平檢測。 miRCURY LNA SYBR Green PCR Kits(貨號:339345、339346、339347) 用于qPCR檢測,包含ROX染料。 miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit(貨號:339320) 爆品 包含該套件包括UniSp6模板及引物,一個候選內(nèi)源對照引物組(miR-103a-3p)和兩個經(jīng)過驗證的引物組(人、大鼠、小鼠),并通過LNA技術(shù)進(jìn)行了增強。這些試劑能夠定量分析多達(dá)20個樣品。 訂購信息 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 |
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| miRCURY LNA SYBR Green PCR Kit
| 2X miRCURY SYBR Green Master Mix, RNase-Free Water
| 339345 |
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| RNA Spike-In Kit, ForRT | 包含 UniSp2、UniSp4、和 UniSp5 RNA 內(nèi)參模板混合物及 cel-miR-39-3p RNA內(nèi)參模板 | 339340 |
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| miRCURY LNA miRNA PCR Assay | 200 次反應(yīng)的 LNA miRNA PCR primers | 339317 |
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| miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit | 2個可選的miRCURY LNA PCR Assay,spike-in templete & assay ,內(nèi)參 assay及20次逆轉(zhuǎn)錄,100次PCR所用的試劑 | 339350 |
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| miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assays | 200 次反應(yīng)的定制探針法 LNA miRNA PCR primers | abs60265 | miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒 | 20T40T | miRNA加尾逆轉(zhuǎn)錄試劑,可配套 miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑使用 | abs60267 | miRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒 | 20T40T | miRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑;加尾的,miRNA探針法熒光定量PCR試劑配套使用 |
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| abs60269 | miRNA莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒 | 25T50T | 莖環(huán)法miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑;與miRNA莖環(huán)染料法熒光定量PCR試劑盒配套使用 |
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| abs60271 | miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑盒 | 200T300T400T | SYBR Green染料法定量試劑,搭配的逆轉(zhuǎn)錄是加尾法的 |
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| miRCURY LNA miRNA QC PCR Panel | 質(zhì)控板,適用于樣本質(zhì)量差,正式panel前的質(zhì)檢 | 339330 |
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四、microRNA功能研究工具 ① miRNA Mimic miRNA mimic被設(shè)計用來模擬自然發(fā)生的、成熟的miRNA。將miRNA模擬物引入細(xì)胞將增加含有該特定miRNA的RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)的比例。通過研究這種miRNA活性增加的表型后果,有可能發(fā)現(xiàn)miRNA的功能。 (1)LNA修飾mimic 訂購信息: ③ miRNA Target Site Blockers 利用靶位點阻斷劑(Target Site Blockers)發(fā)揮miRNA的功能,miRNA通常會調(diào)節(jié)多個靶標(biāo)的基因表達(dá),并且抑制miRNA會導(dǎo)致所有這些靶標(biāo)的抑制。因此,miRNA抑制后觀察到的表型是幾個靶標(biāo)阻遏作用的綜合結(jié)果。然而,放松對這些靶標(biāo)中的一些靶標(biāo)通常會顯著地影響表型。識別這些靶標(biāo)對于理解miRNA的功能至關(guān)重要。靶位點阻斷劑使研究人員能夠研究miRNA對單個靶標(biāo)的作用。 使用靶標(biāo)封閉劑研究 microRNA 的目標(biāo)區(qū)域,從分子角度更有針對性的研究 microRNA 功能。單個目標(biāo)對所獲得的表型的作用可以通過目標(biāo)位點阻斷劑(TSB)進(jìn)行研究,特異性地阻止了microRNA與其中一個RNA靶點的相互作用。 產(chǎn)品特征: · 定制設(shè)計的目標(biāo)位點阻斷劑,用于特異性抑制 miRNA 目標(biāo) · 精巧的設(shè)計和卓越的高親和力,無論目標(biāo)序列如何 · 無與倫比的體外和體內(nèi)功效 · 由于缺乏依賴于 RNase H 的 mRNA 降解,無與倫比的性能和高蛋白表達(dá) · 在非常低的濃度下有效,在目標(biāo)位點上勝過 miRNA · 具有持久反義活性的卓越生物穩(wěn)定性 訂購信息: 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 | miRCURY LNA miRNA Power Target Site Blocker | 體外5nmol,具有不同的標(biāo)簽和純化選項,以管形式提供 | 339199 | 339201 |
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五、LNA檢測探針--NB及原位雜交 ① LNA檢測探針 — Northern Blotting及原位雜交 針對mRNA、lncRNA或miRNA的定位檢測,Exiqon可提供LNA檢測探針,序列特異性強,靈敏度高、探針標(biāo)記方式靈活多樣,尤其適合用于Northern Blotting和原位雜交實驗,可滿足研究者的不同實驗需求。 LNA鎖核酸探針核心優(yōu)勢 ● 無與倫比的靈敏性和特異性 ● 可檢測所有已知的mRNA、lncRNA、microRNA,并可支持定制 ● Tm均一化探針可實現(xiàn)ISH multiplexing及自動化 ● 可提供無標(biāo)記,預(yù)置標(biāo)記及訂制標(biāo)記形式的探針 ● 與放射性及非放射性方法兼容 ● 適用于多種樣本類型 LNA探針已經(jīng)成功的使用在多種樣本類型中(見圖1),包括整體樣本(whole-mount),單細(xì)胞,冷凍切片及FFPE組織樣本等。對于FFPE樣本,我們推薦使用miRCURYLNA microRNA ISH Optimization Kits進(jìn)行優(yōu)化來調(diào)整自己探針的最佳使用量和試劑配比,從而確保自身探針實驗的成功。 圖1:LNA探針已經(jīng)成功的使用在多種樣本類型中
訂購信息 產(chǎn)品 | 說明 | 貨號 |
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| miRCURY LNA miRNA Custom Detection Probes | 1 nmol 或 10 nmol 不同標(biāo)記的定制miRCURY LNA miRNA檢測探針 | 339116 |
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| miRCURY LNA miRNA Detection Probes | 1 nmol 或 10 nmol 不同標(biāo)記的miRCURY LNA miRNA檢測探針 | 339112 | Custom LNA mRNA Detection Probes | 250 nmol 或 1 umol 合成劑量不同標(biāo)記的LNA mRNA探針 | 339501 | Control for Custom LNA mRNA Detection Probes | 5 nmol Custom LNA mRNA對照探針 | 339450 | miRCURY LNA miRNA ISH Optimization Kit (FFPE) | 進(jìn)行miRNA ISH 實驗建立及條件優(yōu)化 | 339459 |
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六、miRNA 相關(guān)轉(zhuǎn)染 ① 基于脂質(zhì)分子的轉(zhuǎn)染試劑--HiPerFect Transfection Reagent (貨號:301705) ● 低至 10 pM siRNA的高效轉(zhuǎn)染 ● 實現(xiàn)低濃度siRNA的使用,最大限度減少脫靶效應(yīng) ● 多種貼壁和懸浮細(xì)胞,以及原代細(xì)胞系已經(jīng)利用 HiPerFect Transfection Reagent成功轉(zhuǎn)染(精選細(xì)胞系詳見表1)。 ● siRNA 的轉(zhuǎn)染可能引起脫靶效應(yīng),產(chǎn)生非特異性的RNAi實驗結(jié)果。使用低濃度的siRNA,可大大降低脫靶效應(yīng)。有了HiPerFect Transfection Reagent,低至10 pM siRNA也能觀察到高效的轉(zhuǎn)染和沉默,讓等量的siRNA可用于更多實驗(圖1)。 表1 成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系 細(xì)胞系 | 細(xì)胞類型 | 所使用的siRNA濃度(實使Knockdown%) | K562 | 人慢性髓性白血病細(xì)胞 | 5nM(85%) | Jurkat | 人T細(xì)胞 | 75nM(83%) | D1.1 | 人T細(xì)胞 | 50nM(84%) | RAW 264.7 | 小鼠巨噬細(xì)胞 | 25nM(77%) | J774.A1 | 小鼠巨噬細(xì)胞 | 50nM(97%) | PMA-di?erentiated THP-1 | 人急性單核細(xì)胞白血病細(xì)胞 | 5nM(82%) | MEL | 鼠紅白血病細(xì)胞 | 5?20nM(50?70%) |
圖1. 皮摩爾siRNA的高效轉(zhuǎn)染。利用HiPerFect Transfection Reagent (3μl),在24孔板中用各種量的CDC2 siRNA和非沉默對照siRNA(對照)轉(zhuǎn)染HeLaS3細(xì)胞。48小時后,通過實時定RT-PCR分析CDC2的表達(dá)。
② PEI陽離子聚合物轉(zhuǎn)染試劑-- INTERFERin? (貨號:101000036、101000028)更少的siRNA,更高的沉默效率,降低脫靶效應(yīng)! ● 高效基因沉默效率:在多種細(xì)胞中達(dá)到超過90%的基因沉默 ● 極低的脫靶效應(yīng):使用低至1nM siRNA ● 溫和的轉(zhuǎn)染模式:保持卓越的細(xì)胞活率 ● 操作簡單:兼容血清和抗生素
圖注:根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)操作手冊在穩(wěn)定表達(dá)熒光素酶的3LL細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)染
圖注:根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)操作手冊在CaSKi細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)染 ③ 活體轉(zhuǎn)染方案---in vivo-jetPEI?(貨號:101000040、101000030) 注射型轉(zhuǎn)染試劑,用于基因治療和疫苗!
in vivo-jetPEI?的優(yōu)勢: ● 使用便捷:兩步操作 ● 給藥方便:可用于各種注射途徑,以達(dá)目標(biāo) ● 量身定制:專家優(yōu)化的操作方案 in vivo-jetPEI?的介紹: ● 適用于任何動物模型的DNAsi/sh/miRNA活體轉(zhuǎn)染 ● 享有盛名:最先進(jìn)的活體轉(zhuǎn)染技術(shù),引用文獻(xiàn)超過700篇 ● 成功的產(chǎn)物:從基礎(chǔ)研究到人臨床研究(提供GMP級產(chǎn)品) 圖注:使用in vivo-jetPEI?在動物模型上的各種給藥途徑
七、miRNA文庫構(gòu)建 ① QIAseq miRNA Library Kit(貨號:331502、331505) 基于分子條形碼技術(shù)的高精度特異性小RNA快速測序文庫構(gòu)建文案 ● 采用分子條形碼(UMI)技術(shù)用于擴增偏倚的去除 ● 最低僅需1ng總RNA,可僅依靠試劑盒內(nèi)含的磁珠進(jìn)行純化而無需切膠回收 ● 可用于miRNA,piRNA等Small RNA的表達(dá)分析以及全新Small RNA的發(fā)現(xiàn) ● 基于qPCR的獨特miRNA QC系統(tǒng)及外源參照,可用于樣本質(zhì)量以及測序后NGS線性度和可重復(fù)性的評估 圖注:“gel-free”小RNA快速文庫構(gòu)建流程
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