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外泌體 & miRNA完整解決方案

 優(yōu)寧維 2022-07-28 發(fā)布于上海

細(xì)胞外囊泡 (extracellular visicles,EV) 是由細(xì)胞釋放出的攜帶并保護(hù)細(xì)胞來源生物信息分子物質(zhì)的特殊結(jié)構(gòu),可通過轉(zhuǎn)運核酸和蛋白質(zhì)等生物信息物質(zhì)參與體內(nèi)靶細(xì)胞的信號調(diào)節(jié),并作為藥物或疫苗的載體在抗腫瘤治療、干細(xì)胞治療等領(lǐng)域發(fā)揮關(guān)鍵作用,而其中EV中的RNA分子 (exoRNA) 因其獨特的表達(dá)模式而受到了最為廣泛的關(guān)注。

一、外泌體及miRNA純化

① 外泌體純化
沉淀法miRCURY?外泌體純化試劑盒 暢銷
※ 從不同起始材料中進(jìn)行外泌體提?。耗蛞簶颖?-10 mL,CSF樣本1 mL,細(xì)胞培養(yǎng)液 1-10 mL ;血漿/血清0.2-1.4mL
※ 2小時內(nèi)完成外泌體提取
※ 無需高速離心及酚/氯仿提取
※ 適用于多種應(yīng)用,如miRNA或RNA profiling

訂購信息

產(chǎn)品說明貨號
miRCURY Exosome Serum/Plasma Kit沉淀法,從血清或血漿中提取外泌體及其他胞外囊泡76743

親和柱膜法外泌體分離及外泌體內(nèi)RNA(含miRNA)的純化
exoEasy Maxi Kit  貨號:76064
從血漿、血清、細(xì)胞培養(yǎng)上清及其他生物液體中分離完整的exosome及其他細(xì)胞外囊泡

※ 適用于囊泡功能性檢測及物理和生化分析
※ 可在25分鐘內(nèi)純化獲得exosome及其他細(xì)胞外囊泡
※ 離心柱純化流程,可平行處理多個樣品
※ 可處理大體積的樣品(4 ml血漿或血清,或32ml細(xì)胞培養(yǎng)上清),靈敏檢測低豐度轉(zhuǎn)錄本

exoRNeasy Serum/Plasma Kit  暢銷
采用親和性膜離心柱,可從來自血清、血漿、尿液、細(xì)胞上清等樣本中分離exosome和其他細(xì)胞外微泡中高效分離RNA。該試劑盒能夠快速、便利的獲得結(jié)果,十分適用于敏感的下游應(yīng)用。

訂購信息

產(chǎn)品說明貨號
exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit (50)過柱法,直接從樣本里面得到外泌體里面的RNA,4ml上樣量77144
exoRNeasy Serum/Plasma Starter Kit (20)過柱法,直接從樣本里面得到外泌體里面的RNA, 10個4ml+10個1ml上樣的柱子76064

特殊樣本外泌體及miRNA純化試劑盒訂購指南

提取方法適用樣本上樣量貨號品名規(guī)格說明
膜親和法血漿、血清、腦脊液1-4ml76214Buffer XE (45 ml)45ml洗脫囊泡的buffer
細(xì)胞培養(yǎng)上清8ml77164-QiagenexoRNeasy Maxi Kit (50)50T提取外泌體以及外泌體中的總RNA
樣本量大于8ml76214Buffer XE (45 ml)45ml洗脫囊泡的buffer
尿液4ml77164-QiagenexoRNeasy Maxi Kit (50)50T提取外泌體以及外泌體中的總RNA
/74204RNeasy MinElute Cleanup Kit (50)50T用于尿液樣本中short RNA的提取的柱子

































② miRNA純化:Copurifcation of miRNA and total RNA 
產(chǎn)品特點:
※ 可以單獨富集各種組織、細(xì)胞樣品中的miRNA和其他小RNAs (>18nt),做芯片分析時單獨分離可能會有幫助 
※ 推薦同步純化包含miRNA的總RNA,這樣有助于一次cDNA合成可以獲得所有類型RNA信息,便于同時進(jìn)行miRNA,mRNA或其他非編碼RNA檢測
※ 硅膠膜技術(shù)確保獲得最好純度miRNA,不會有Trizol方法帶來的選擇性miRNA丟失,適合各種下游檢測

miRNeasy Serum/Plasma Kit (貨號:217184)
※ 同樣使用經(jīng)典的硅膠膜法
※ 該試劑盒適用于使用檸檬酸鹽或EDTA抗凝的血清 (不能使用肝素,會干擾下游的實驗)
※ 保證清洗緩沖液的溫度在20-30°C,否則會有鹽類的殘留
※ 配合使用Spick-in control,對純化效率及下游檢測進(jìn)行監(jiān)測

miRNeasy Serum/Plasma Kit
RNA片段選擇大于18nt
起始樣本量200ul
最小洗脫體積10ul
RNA產(chǎn)量60-150ng
內(nèi)參C.elegans miR-39

miRNeasy Serum/Plasma Advanced Kit (貨號:217204) 暢銷
※ 無需苯酚裂解,更易于在QIAcube進(jìn)行自動化操作
※ 采用UCP MinElute純化柱,更安全、更小洗脫體積
※ 純化高品質(zhì)含胞外/外泌體非編碼RNA(miRNA)的總RNA,適合任何下游應(yīng)用

miRNA純化試劑盒訂購指南

樣本類型試劑盒名稱試劑盒貨號樣品量洗脫體積處理純化類型應(yīng)用
動物組織或細(xì)胞miRNeasy Mini Kit2170845mg(脂肪10mg)組織,
1 x 10 6細(xì)胞
10ul



miRNeasy 96 Kitabs6026110-20mg的組織30ul手動miRNAPCR, qPCR, real-time RT-PCR,
microarray

細(xì)胞miRNA提取試劑盒217604最多30 mg冷凍組織(15 mg穩(wěn)定組織),
最多1 x 107的細(xì)胞
30 μl手動(監(jiān)控),自動(QIAcube連接)miRNA, total RNANGS, real-time RT-PCR, microarray
miRNeasy Tissue/Cells Advanced Micro kit80224組織:不超過30 mg的新鮮或冷凍組織;細(xì)胞:不超過1 x 107細(xì)胞//DNA、RNA、miRNA/
血液樣本血液miRNA提取試劑盒abs60263200μL外泌體樣本40 μl手動Total RNA,miRNA,PCR, qPCR, real-time RT-PCR,
microarray
FFPE組織切片miRNeasy FFPE Kit76544100 μl or 500 μl animal blood14 μl手動(離心)Total RNANorthern、雜交、RT-PCR、定量、實時RT-PCR、下一代測序、陣列分析
PAXgene Tissue Container 中的組織PAXgene Tissue miRNA Kit7631342.5 ml40 μl手動(離心)或在QIAcube上miRNART-PCR和實時RT-PCR、cDNA合成、northern、dot和slot blot分析、引物延伸、微陣列分析
血清、血漿、尿液等無細(xì)胞體液miRNeasy Serum/Plasma Advanced Kitabs60264≤ 200ul30ul手動(離心)RT-PCR和實時RT-PCR、cDNA合成、northern、dot和slot blot分析、引物延伸、微陣列分析
miRNeasy Serum/Plasma Kit21700450mg(脂肪100mg)組織,1 x 107細(xì)胞30 μl手動(離心或真空)miRNA, total RNAPCR, qPCR, real-time RT-PCR,
microarray

















二、miRNA定量

① miRCURY LNA miRNA qPCR檢測系統(tǒng)

Exiqon microRNA qPCR系統(tǒng)將通用逆轉(zhuǎn)錄的高靈敏度,高效率與鎖核酸修飾的定量引物的高特異性相結(jié)合,在3個小時之內(nèi)即可完成microRNA表達(dá)分析。miRCURY LNA miRNA qPCR系統(tǒng)可提供assays及panels規(guī)格,20ng total RNA無需預(yù)擴增即可在96孔及384孔板上進(jìn)行上百microRNAs的精準(zhǔn)定量。miRCURY LNA miRNA qPCR檢測系統(tǒng)具有以下特點:
● 極高的靈敏度:低至1pg total RNA即可進(jìn)行可靠的定量
● 極高的特異性:LNA引物可精確區(qū)分只有一個堿基差異的miRNA異構(gòu)體
● 實驗操作簡單方便:在3小時內(nèi)即可完成從樣本到數(shù)據(jù)分析的整個流程

miRCURY LNA RT kit (貨號:339340
用于一鏈合成,與miRCURY LNA miRNA PCR Assays / Panels搭配使用效果最佳,包含RNA spike-in模板。

miRCURY LNA miRNA PCR Assay / Custom PCR Assay / miRCURY LNA miRNA PCR Panels
200次反應(yīng)的預(yù)制或定制LNA miRNA PCR primers,用于目標(biāo)miRNA表達(dá)水平檢測。

miRCURY LNA SYBR Green PCR Kits(貨號:339345、339346、339347
用于qPCR檢測,包含ROX染料。

miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit(貨號:339320) 爆品
包含該套件包括UniSp6模板及引物,一個候選內(nèi)源對照引物組(miR-103a-3p)和兩個經(jīng)過驗證的引物組(人、大鼠、小鼠),并通過LNA技術(shù)進(jìn)行了增強。這些試劑能夠定量分析多達(dá)20個樣品。

訂購信息

產(chǎn)品說明貨號


miRCURY LNA SYBR Green PCR Kit
2X miRCURY SYBR Green Master Mix, RNase-Free Water
339345


339346


339347


RNA Spike-In Kit, ForRT包含 UniSp2、UniSp4、和 UniSp5 RNA 內(nèi)參模板混合物及 cel-miR-39-3p RNA內(nèi)參模板339340


miRCURY LNA miRNA PCR Assay200 次反應(yīng)的 LNA miRNA PCR primers339317


miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit2個可選的miRCURY LNA PCR Assay,spike-in templete & assay ,內(nèi)參 assay及20次逆轉(zhuǎn)錄,100次PCR所用的試劑339350


miRCURY LNA miRNA Custom Probe PCR Assays200 次反應(yīng)的定制探針法 LNA miRNA PCR primersabs60265miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒20T40TmiRNA加尾逆轉(zhuǎn)錄試劑,可配套 miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑使用
abs60267miRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒20T40TmiRNA探針法逆轉(zhuǎn)錄試劑;加尾的,miRNA探針法熒光定量PCR試劑配套使用

abs60269miRNA莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒25T50T莖環(huán)法miRNA逆轉(zhuǎn)錄試劑;與miRNA莖環(huán)染料法熒光定量PCR試劑盒配套使用

abs60271miRNA加尾染料法熒光定量PCR試劑盒200T300T400TSYBR Green染料法定量試劑,搭配的逆轉(zhuǎn)錄是加尾法的

339325




miRCURY LNA miRNA QC PCR Panel質(zhì)控板,適用于樣本質(zhì)量差,正式panel前的質(zhì)檢339330


四、microRNA功能研究工具

① miRNA Mimic
 miRNA mimic被設(shè)計用來模擬自然發(fā)生的、成熟的miRNA。將miRNA模擬物引入細(xì)胞將增加含有該特定miRNA的RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)的比例。通過研究這種miRNA活性增加的表型后果,有可能發(fā)現(xiàn)miRNA的功能。

(1)LNA修飾mimic
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產(chǎn)品說明貨號

miRCURY LNA miRNA Mimic5nmol或20nmol,標(biāo)準(zhǔn)脫鹽可選FAM標(biāo)簽339173

339174

miRCURY LNA Premium miRNA Mimic5nmol,HPLC純化,帶有生物素標(biāo)簽C-HMR-XX-0005

C-HMR-XX-0050


C-HMR-XX-0002


shMIMIC Lentiviral microRNA甘油菌質(zhì)粒GSH11926
GSH11929
GSR11931
miRIDIAN microRNA Hairpin Inhibitor2/5/10/20/50 nmolIH-HMR-XX-0010
IH-HMR-XX-0050
339121
miRCURY LNA miRNA Power Inhibitors1 nmol、5nmol或15nmol;骨架PS(不易降解),效率比普通版本更高,無需轉(zhuǎn)染試劑,可選FAM標(biāo)簽339131
339141
339146

Custom miRCURY LNA miRNA Inhibitors in vivo Large Scale定制的miRCURY LNA miRNA體內(nèi)大規(guī)模抑制劑,通過HPLC和Na +鹽交換純化,可用量為5 mg – 1 kg 之間可選擇IH-HMR-XX-0005

IH-HMR-XX-0020


IH-HMR-XX-0002


阻遏物Inhibitor陽性對照陰性對照轉(zhuǎn)染對照
MiR-16Negative1, 2Transfection Control with Dy547

③ miRNA Target Site Blockers
利用靶位點阻斷劑(Target Site Blockers)發(fā)揮miRNA的功能,miRNA通常會調(diào)節(jié)多個靶標(biāo)的基因表達(dá),并且抑制miRNA會導(dǎo)致所有這些靶標(biāo)的抑制。因此,miRNA抑制后觀察到的表型是幾個靶標(biāo)阻遏作用的綜合結(jié)果。然而,放松對這些靶標(biāo)中的一些靶標(biāo)通常會顯著地影響表型。識別這些靶標(biāo)對于理解miRNA的功能至關(guān)重要。靶位點阻斷劑使研究人員能夠研究miRNA對單個靶標(biāo)的作用。

使用靶標(biāo)封閉劑研究 microRNA 的目標(biāo)區(qū)域,從分子角度更有針對性的研究 microRNA 功能。單個目標(biāo)對所獲得的表型的作用可以通過目標(biāo)位點阻斷劑(TSB)進(jìn)行研究,特異性地阻止了microRNA與其中一個RNA靶點的相互作用。

產(chǎn)品特征:
· 定制設(shè)計的目標(biāo)位點阻斷劑,用于特異性抑制 miRNA 目標(biāo)
· 精巧的設(shè)計和卓越的高親和力,無論目標(biāo)序列如何
· 無與倫比的體外和體內(nèi)功效
· 由于缺乏依賴于 RNase H 的 mRNA 降解,無與倫比的性能和高蛋白表達(dá)
· 在非常低的濃度下有效,在目標(biāo)位點上勝過 miRNA
· 具有持久反義活性的卓越生物穩(wěn)定性     

訂購信息:

產(chǎn)品說明貨號
miRCURY LNA miRNA Power Target Site Blocker體外5nmol,具有不同的標(biāo)簽和純化選項,以管形式提供339199
339201

五、LNA檢測探針--NB及原位雜交
① LNA檢測探針 — Northern Blotting及原位雜交
針對mRNA、lncRNA或miRNA的定位檢測,Exiqon可提供LNA檢測探針,序列特異性強,靈敏度高、探針標(biāo)記方式靈活多樣,尤其適合用于Northern Blotting和原位雜交實驗,可滿足研究者的不同實驗需求。

LNA鎖核酸探針核心優(yōu)勢
● 無與倫比的靈敏性和特異性
● 可檢測所有已知的mRNA、lncRNA、microRNA,并可支持定制
● Tm均一化探針可實現(xiàn)ISH multiplexing及自動化
● 可提供無標(biāo)記,預(yù)置標(biāo)記及訂制標(biāo)記形式的探針
● 與放射性及非放射性方法兼容
● 適用于多種樣本類型

LNA探針已經(jīng)成功的使用在多種樣本類型中(見圖1),包括整體樣本(whole-mount),單細(xì)胞,冷凍切片及FFPE組織樣本等。對于FFPE樣本,我們推薦使用miRCURYLNA microRNA ISH Optimization Kits進(jìn)行優(yōu)化來調(diào)整自己探針的最佳使用量和試劑配比,從而確保自身探針實驗的成功。


圖1:LNA探針已經(jīng)成功的使用在多種樣本類型中

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產(chǎn)品說明貨號

miRCURY LNA miRNA Custom Detection Probes1 nmol 或 10 nmol 不同標(biāo)記的定制miRCURY LNA miRNA檢測探針339116

miRCURY LNA miRNA Detection Probes1 nmol 或 10 nmol 不同標(biāo)記的miRCURY LNA miRNA檢測探針339112
Custom LNA mRNA Detection Probes250 nmol 或 1 umol 合成劑量不同標(biāo)記的LNA mRNA探針339501
Control for Custom LNA mRNA Detection Probes5 nmol Custom LNA mRNA對照探針339450
miRCURY LNA miRNA ISH Optimization Kit (FFPE)進(jìn)行miRNA ISH 實驗建立及條件優(yōu)化339459




六、miRNA 相關(guān)轉(zhuǎn)染
① 基于脂質(zhì)分子的轉(zhuǎn)染試劑--HiPerFect Transfection Reagent (貨號:301705
● 低至 10 pM siRNA的高效轉(zhuǎn)染
● 實現(xiàn)低濃度siRNA的使用,最大限度減少脫靶效應(yīng)
● 多種貼壁和懸浮細(xì)胞,以及原代細(xì)胞系已經(jīng)利用 HiPerFect Transfection Reagent成功轉(zhuǎn)染(精選細(xì)胞系詳見表1)。
● siRNA 的轉(zhuǎn)染可能引起脫靶效應(yīng),產(chǎn)生非特異性的RNAi實驗結(jié)果。使用低濃度的siRNA,可大大降低脫靶效應(yīng)。有了HiPerFect Transfection Reagent,低至10 pM siRNA也能觀察到高效的轉(zhuǎn)染和沉默,讓等量的siRNA可用于更多實驗(圖1)。

表1 成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系

細(xì)胞系細(xì)胞類型所使用的siRNA濃度(實使Knockdown%)
K562人慢性髓性白血病細(xì)胞5nM(85%)
Jurkat人T細(xì)胞75nM(83%)
D1.1人T細(xì)胞50nM(84%)
RAW 264.7小鼠巨噬細(xì)胞25nM(77%)
J774.A1小鼠巨噬細(xì)胞50nM(97%)
PMA-di?erentiated THP-1人急性單核細(xì)胞白血病細(xì)胞5nM(82%)
MEL鼠紅白血病細(xì)胞5?20nM(50?70%)


圖1. 皮摩爾siRNA的高效轉(zhuǎn)染。利用HiPerFect Transfection Reagent (3μl),在24孔板中用各種量的CDC2 siRNA和非沉默對照siRNA(對照)轉(zhuǎn)染HeLaS3細(xì)胞。48小時后,通過實時定RT-PCR分析CDC2的表達(dá)。

② PEI陽離子聚合物轉(zhuǎn)染試劑-- INTERFERin? (貨號:101000036、101000028)更少的siRNA,更高的沉默效率,降低脫靶效應(yīng)!
● 高效基因沉默效率:在多種細(xì)胞中達(dá)到超過90%的基因沉默
● 極低的脫靶效應(yīng):使用低至1nM siRNA
● 溫和的轉(zhuǎn)染模式:保持卓越的細(xì)胞活率
● 操作簡單:兼容血清和抗生素


圖注:根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)操作手冊在穩(wěn)定表達(dá)熒光素酶的3LL細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)染

圖注:根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)操作手冊在CaSKi細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)染

③ 活體轉(zhuǎn)染方案---in vivo-jetPEI?(貨號:101000040、101000030
注射型轉(zhuǎn)染試劑,用于基因治療和疫苗!

in vivo-jetPEI?的優(yōu)勢:
● 使用便捷:兩步操作
● 給藥方便:可用于各種注射途徑,以達(dá)目標(biāo)
● 量身定制:專家優(yōu)化的操作方案

in vivo-jetPEI?的介紹:
● 適用于任何動物模型的DNAsi/sh/miRNA活體轉(zhuǎn)染
● 享有盛名:最先進(jìn)的活體轉(zhuǎn)染技術(shù),引用文獻(xiàn)超過700篇
● 成功的產(chǎn)物:從基礎(chǔ)研究到人臨床研究(提供GMP級產(chǎn)品)


圖注:使用in vivo-jetPEI?在動物模型上的各種給藥途徑

七、miRNA文庫構(gòu)建

① QIAseq miRNA Library Kit(貨號:331502、331505
基于分子條形碼技術(shù)的高精度特異性小RNA快速測序文庫構(gòu)建文案
● 采用分子條形碼(UMI)技術(shù)用于擴增偏倚的去除
● 最低僅需1ng總RNA,可僅依靠試劑盒內(nèi)含的磁珠進(jìn)行純化而無需切膠回收
● 可用于miRNA,piRNA等Small RNA的表達(dá)分析以及全新Small RNA的發(fā)現(xiàn)
● 基于qPCR的獨特miRNA QC系統(tǒng)及外源參照,可用于樣本質(zhì)量以及測序后NGS線性度和可重復(fù)性的評估


圖注:“gel-free”小RNA快速文庫構(gòu)建流程

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