英文題目:Vaginal microbiome dysbiosis as a novel noninvasive biomarker for detection of chronic endometritis in infertile women 中文題目:陰道微生物群失調(diào)作為檢測不孕女性慢性子宮內(nèi)膜炎的新型非侵入性生物標志物 期刊名:OBSTETRICS AND GYNECOLOGY 發(fā)表時間:2024年7月10日 什么是慢性子宮內(nèi)膜炎? 慢性子宮內(nèi)膜炎是發(fā)生在子宮內(nèi)膜間質(zhì)區(qū)的持續(xù)性細微炎癥性疾病,其特征為子宮內(nèi)膜間質(zhì)區(qū)的漿細胞浸潤,通常無癥狀或僅出現(xiàn)輕微的癥狀,如異常子宮出血、盆腔疼痛、白帶增多等。 慢性子宮內(nèi)膜炎有哪些不良后果? 大量研究表明,慢性子宮內(nèi)膜炎與女性不孕癥、反復流產(chǎn)、反復著床失敗、子宮內(nèi)粘連和輔助生殖技術的不良后果密切相關,此外慢性子宮內(nèi)膜炎還是影響活產(chǎn)和足月分娩的客觀因素之一。 慢性子宮內(nèi)膜炎的發(fā)病率 慢性子宮內(nèi)膜炎的發(fā)病率在不同人群中不盡相同:
其病理改變與內(nèi)膜中微生物群的定性、定量改變有關。 近年來,人類微生物組學的研究表明,人體不同系統(tǒng)內(nèi)微生物群與人類健康和疾病發(fā)病機制存在密切關系,刺激炎癥并增加癌癥等疾病發(fā)生的風險。作為人體主要的微生物組,陰道菌群對于女性生理和生殖健康起著重要作用。 ◆陰道病原體感染是慢性子宮內(nèi)膜炎的病因之一 Moreno等人通過微生物培養(yǎng)在慢性子宮內(nèi)膜炎女性子宮內(nèi)膜中發(fā)現(xiàn)了包括無乳鏈球菌和淋病奈瑟菌在內(nèi)的細菌,并開發(fā)了一種診斷慢性子宮內(nèi)膜炎的分子方法——逆轉錄聚合酶鏈反應試驗,從這些病原體中識別DNA,用于慢性子宮內(nèi)膜炎的診斷。 ◆慢性子宮內(nèi)膜炎:宮腔內(nèi)致病菌增加 隨著微生物組學技術的發(fā)展,傳統(tǒng)觀點認為宮腔內(nèi)是無菌環(huán)境的觀念也逐漸被推翻。16S和宏基因組測序等技術均證實宮腔內(nèi)存在微生物的定植,健康女性以乳桿菌屬占絕對優(yōu)勢,且宮腔內(nèi)微生物與慢性子宮內(nèi)膜炎的發(fā)病存在關聯(lián),慢性子宮內(nèi)膜炎患者宮腔非乳酸桿菌為優(yōu)勢菌群且致病菌如加德納菌、葡萄球菌、鏈球菌檢出率增加。 在研究中也指出,診斷患有慢性子宮內(nèi)膜炎的女性陰道微生物群生態(tài)失調(diào)。與子宮內(nèi)膜沖洗樣品相比,陰道分泌物可以作為診斷慢性子宮內(nèi)膜炎的更無創(chuàng)和更經(jīng)濟有效的生物標志物。陰道宮頸黏液的免疫學指標已被認為是子宮內(nèi)膜炎的潛在診斷生物標志物。然而,需要進一步評估陰道微生物組在慢性子宮內(nèi)膜炎中的診斷潛力。 本研究于2023年6月至2023年11月在武漢大學人民醫(yī)院生殖醫(yī)學中心完成。研究集中于常規(guī)不孕癥檢查中接受子宮內(nèi)膜活檢的患者。最終共納入49名患有慢性子宮內(nèi)膜炎的女性,并與49名非慢性子宮內(nèi)膜炎對照組相匹配。 實驗對象 慢性子宮內(nèi)膜炎患者的選擇標準如下:
排除標準為:
注:所有受試者均獲得書面同意,并經(jīng)武漢大學人民醫(yī)院倫理委員會批準(批準通知號:WDRY2023- K090)。 研究過程 該研究的設計和流程圖如圖所示: 在本研究中,所有樣本均在子宮內(nèi)膜活檢前采集。用無菌生理鹽水擦拭外陰。隨后,使用無潤滑劑的一次性無菌陰道窺鏡完全暴露宮頸。使用兩個無菌拭子從后穹窿收集陰道分泌物:一個使用Nugent評分法進行評估,另一個儲存在?80°C下用于后續(xù)16S rRNA基因測序分析。 項目采用杭州谷禾核酸提取試劑盒(GHFDE100)提取陰道沖洗液樣本的基因組DNA。用引物515F(5'- GTGCCAGCMGCCGCGGTAA- 3')和806R(5'- GGACTACHVGGGTWTCTAAT- 3')擴增16S rRNA的V4區(qū)。為了實現(xiàn)多重測序,將樣品特異性對端6bp條形碼集成到TrueSeq適配器中。純化和定量后,整個DNA池在Illumina NovaSeq6000平臺(Illumina)上按照協(xié)議進行測序。 使用Vsearch v2.22.1組裝拼接雙端序列,并以100%的相似性閾值將序列聚類為相同的擴增子序列變體(amplicon sequence variant, ASV)。利用QIIME2加權分類器獲得ASV的分類信息。基于R包“VennDiagram”生成維恩圖來說明分組間共有的和獨有的ASV。 α-多樣性是指群落內(nèi)的物種多樣性,以物種豐富度和歸一化香農(nóng)熵(均勻度)為其顯著組成部分。物種豐富度采用Chao1指數(shù)進行量化,而Shannon多樣性指數(shù)同時評估豐富度和均勻度。通過主坐標分析(PCoA)可視化兩個組之間樣本的微生物菌落結構。使用R的vegan包進行相似性分析(ANOSIM)評估微生物群落的差異。 此外,為了預測微生物的代謝功能,使用京都基因與基因組百科全書(KEGG)數(shù)據(jù)庫與PICRUSt2 (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States)進行代謝途徑富集分析。組間的統(tǒng)計差異使用Kruskal-Wallis檢驗和Wilcoxon秩和檢驗進行評估,顯著性水平定義為P < 0.05。 為了評估陰道微生物群組成對慢性子宮內(nèi)膜炎(CE)的診斷潛力,應用隨機森林算法,這是一種穩(wěn)健的監(jiān)督學習算法。使用R的pROC軟件包生成的受試者工作特征(ROC)曲線評估模型的整體性能。曲線下的面積(AUC)量化了ROC曲線的判別能力。此外,還計算模型的特異性、敏感性和準確性。 連續(xù)變量的臨床特征差異使用Student's t檢驗進行評估,而分類變量則需要使用χ2檢驗或Fisher精確檢驗進行評估。統(tǒng)計分析使用SPSS版本27(IBM)進行,P < 0.05被認為具有統(tǒng)計學意義。 在98名參與者中,49名被診斷為CE,其標準是在30個隨機選擇的高倍視野中至少有一個視野中觀察到超過5個MUM-1+/CD138+細胞?;€特征包括年齡、體重指數(shù)、抗穆勒激素水平和流產(chǎn)史,在兩組之間顯示了可比性(見表1)。 等級豐度曲線體現(xiàn)了物種豐富度和均勻度 等級豐度曲線描述了兩組微生物群落的物種豐富度和均勻度。曲線范圍越寬表明物種豐度越高,曲線越光滑表明物種分布越均勻。 從曲線上看,CE組的物種豐富度和均勻度高于非CE組(圖2a)。維恩圖顯示,兩組共有1180個ASV中的664個,其中CE組特有的ASV為354個(圖2b)。利用Chao1豐富度估計器和Shannon多樣性指數(shù)量化的α-多樣性結果顯示,兩組間差異不顯著(Chao1的P = 0.1733, Shannon的P = 0.9043,圖2c,d)。 為了說明樣品之間的微生物組分布空間,進行了PCoA,如圖2e所示。結果顯示,兩組樣本的分布是對稱的。 值得注意的是,ANOSIM結果顯示組間差異大于組內(nèi)差異,盡管沒有達到統(tǒng)計學意義(R = 0.022, P = 0.085)(圖2f)。 陰道微生物群的細菌多樣性 (a)用秩豐度曲線評價細菌的相對均勻度; (b)顯示組間重疊的維恩圖; (c)采用Chao1指數(shù); (d)Simpson指數(shù)估算口腔微生物多樣性; (e)使用Bray-Curtis通過主坐標分析計算β多樣性; (f)通過相似性分析計算了組間微生物群落的差異。 陰道微生物群的組成 文中分析了與CE相關的陰道微生物組的分類組成和變化。門、科和屬水平的平均細菌群落組成如圖3a-c所示。值得注意的是,與非CE組相比,CE組有10個屬的細菌顯著富集,包括雙歧桿菌、普雷沃氏菌和加德納菌(均P?<?0.05)(圖3d)。 慢性子宮內(nèi)膜炎患者陰道微生物群落的系統(tǒng)發(fā)育概況 門(a)、科(b)、屬(c)水平上細菌群落的平均組成。CE組與非CE組間差異有統(tǒng)計學意義(均 P?<?0.05)。0.01 <矯正 P?≤?0.05 ,標記為*。 代謝途徑 通過KEGG途徑富集的功能分析揭示了CE組中幾種上調(diào)的途徑,如圖4所示。具體而言,參與多糖生物合成和代謝的途徑(包括鞘糖脂生物合成、糖胺聚糖降解和其他多糖降解過程)上調(diào)。 此外,萜類和聚酮類代謝、II型聚酮類生物合成、鞘脂質(zhì)代謝、次生代謝物生物合成、鏈霉素生物合成、外源生物降解、氯烷烴和氯烯烴降解以及凋亡相關途徑也上調(diào)??偣灿?個KEGG模塊在CE組顯著富集,重點是代謝相關途徑(均P?<?0.05)。 KEGG代謝通路的豐度差異 0.01<?校正P≤0.05,標記為*;0.001?<校正P≤0.01,標記為**。CE,慢性子宮內(nèi)膜炎。 為測試陰道微生物組對慢性子宮內(nèi)膜炎(CE)的診斷潛力,這里構建了一個隨機森林分類器模型,用以區(qū)分CE樣本和非CE樣本。訓練集用于模型訓練,測試集用于評估模型性能。通過在發(fā)現(xiàn)階段重復五次的10倍交叉驗證,我們識別出四個最優(yōu)標記 ASV 作為CE的標記集(圖5a)。 這些選定ASV的對應細菌屬包括:
隨機森林模型在訓練集隊列上的AUC值為85.68%(95%置信區(qū)間[CI], 75.62%-95.73%),在測試集隊列上的AUC值為83.26% (95% CI, 68.67%-97.85%)(圖5b)。模型的特異性為82.76%,靈敏度為79.49%,準確率為80.88%。 這些發(fā)現(xiàn)表明,基于陰道微生物ASV標記的隨機森林模型在區(qū)分CE和非CE隊列方面表現(xiàn)出強大的診斷潛力。 圖5.通過隨機森林模型鑒定用于臨床診斷的微生物標志物。 (a)使用陰道樣品中四種選定生物標志物的概況,來自隨機森林模型的變量的平均降低準確度。 (b)接收器工作特征曲線基于組織樣本的訓練集和測試集。ASV,擴增子序列變體; AUC,曲線下面積。 ◆陰道菌群的變化可引起宮腔的菌群失調(diào) 女性陰道中的微生物組是一個完整的連續(xù)體觀點已被廣泛接受。陰道細菌可以異位定植并改變上生殖道中的微生物組。局部微生物組的生態(tài)失調(diào)會導致微環(huán)境發(fā)生復雜的病理生理變化,最終擾亂與免疫反應、炎癥和凋亡相關的各種過程,從而促進病理狀況。 陰道和宮腔內(nèi)的菌群變化有一定的同步性,陰道菌群的變化可引起宮腔內(nèi)的菌群失調(diào),從而影響女性生殖健康。 本研究旨在對有或沒有慢性子宮內(nèi)膜炎(CE)的女性陰道微生物組的群落結構和功能進行初步探索。此外,文章中還提出了基于陰道微生物ASV的新型非侵入性CE診斷標志物。 ◆特定的菌群可作為新型非侵入性CE診斷標志物 與先前的研究結果一致,該研究中沒有發(fā)現(xiàn)慢性子宮內(nèi)膜炎組和非慢性子宮內(nèi)膜炎組陰道微生物組之間的α-多樣性或β-多樣性有顯著差異。 值得注意的是,微生物組的低組內(nèi)變異情況表明其作為潛在診斷標記具有一定的穩(wěn)健性。與非CE組相比,慢性子宮內(nèi)膜炎組中幾個低豐度屬的富集程度不同,包括雙歧桿菌,普雷沃氏菌和加德納菌。 雙歧桿菌 雙歧桿菌以其保護作用而聞名,其高豐度在CE組中令人驚訝。雙歧桿菌菌株作為益生菌用于腸道炎癥、嚴重疾病和抑郁癥患者的腸道微生物組調(diào)節(jié)已有很長的歷史。然而,其他研究報告稱,在一些不健康的情況下,包括子宮內(nèi)膜異位癥、高危人乳頭瘤病毒和不孕癥,陰道中雙歧桿菌含量很高。這種不一致的潛在機制尚不清楚,需要進一步研究。 加德納菌和普氏菌 加德納菌和普氏菌是公認的陰道生態(tài)失調(diào)的指標。這些屬的定植改變了免疫系統(tǒng),并誘導了促炎反應。在宿主-微生物共培養(yǎng)模型中,加德納菌與宮頸陰道屏障的破壞有關,同時促進小鼠中普雷沃菌屬對上生殖道的侵入性感染。 總的來說,該研究結果表明,兩組之間的陰道微生物組發(fā)生了實質(zhì)性變化,突顯了陰道沖洗液樣本作為檢測慢性子宮內(nèi)膜炎的診斷工具的潛力。 ◆陰道菌群的變化可引起宮腔的菌群失調(diào) KEGG途徑富集分析強調(diào)了關鍵代謝過程的上調(diào),特別是CE組的聚糖生物合成和代謝。覆蓋陰道上皮細胞的聚糖涂層是保護屏障的重要組成部分。乳桿菌與陰道上皮的粘附被認為是具有競爭性地抑制病原體,而上皮的糖胺聚糖在這些過程中起著至關重要的作用。 值得注意的是,糖胺聚糖的消耗與宮頸上皮細胞屏障功能的破壞有關,這可能會增加對局部細菌和上升感染的易感性。這表明CE患者的微生物組失調(diào)可能會對微生物侵入陰道的主要門戶產(chǎn)生負面影響,并引發(fā)宮內(nèi)炎癥。 總結 關于慢性子宮內(nèi)膜炎(CE)的標準化定義和診斷指南仍存在爭議,最被接受的診斷依賴于子宮內(nèi)膜活檢。基于選定的陰道微生物群構建了CE診斷模型。本文研究中,引入了一種新的隨機森林模型,該模型可以根據(jù)ASV以更高的靈敏度和準確性將CE患者與使用陰道分泌物的健康個體區(qū)分開來。該研究結果表明,陰道微生物組的變化可以作為診斷CE的指標,為慢性子宮內(nèi)膜炎提供了一種更容易獲得和更方便患者的診斷選擇。 然而,該研究也存在一定的局限性。首先,它主要側重于檢查有慢性子宮內(nèi)膜炎和沒有慢性子宮內(nèi)膜炎的女性之間的成分差異,而不是研究與慢性炎癥相關的免疫失調(diào)的潛在機制。其次,陰道微生物樣本是在分泌中期收集的,這可能無法解釋整個月經(jīng)周期中微生物群組成的變化。第三,作為一項單中心調(diào)查,發(fā)現(xiàn)的普遍性可能有限??紤]到飲食和運動等因素,多中心方法可以提供更全面的解讀。 最后,多種組學方法的整合(包括培養(yǎng)組學、元轉錄組學和代謝組學),可以提供對微生物群落功能的全面了解。這種更廣泛的視角對于闡明陰道微生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)復雜的網(wǎng)絡和陰道微環(huán)境的潛在變化至關重要。 陰道微生物生態(tài)失調(diào)是慢性子宮內(nèi)膜炎的重要指標。該研究確定了與慢性子宮內(nèi)膜炎發(fā)展相關的潛在候選細菌,并提出了潛在的機制。基于陰道微生物群的生物標志物有望成為檢測慢性子宮內(nèi)膜炎的非侵入性工具。需要進一步的研究來發(fā)現(xiàn)特定陰道微生物組在慢性子宮內(nèi)膜炎中的功能,并確定具有診斷能力的強大陰道微生物標記物,以區(qū)分患有慢性子宮內(nèi)膜炎的個體。 |
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